Die Kanzlerin ist Mitglied des Rektorats und führt die Geschäfte der Universitätsverwaltung. Ihr obliegt die Wirtschafts- und Personalverwaltung.

Die Mitarbeitenden der Rechtsstelle (K-R) erbringen juristische Dienstleistungen für die Universitätsleitung, die Fakultäten, die zentrale Universitätsverwaltung und die zentralen Einrichtungen in allen die OVGU betreffenden Angelegenheiten. Die Rechtsstelle ist der Kanzlerin direkt unterstellt.

Seit dem 1. Januar 2006 ist das Universitätsklinikum Magdeburg eine rechtsfähige Anstalt des öffentlichen Rechts (A.ö.R.) des Landes Sachsen-Anhalt. Die Universitätsmedizin Magdeburg besteht aus dem Universitätsklinikum Magdeburg und der Medizinischen Fakultät der Universität Magdeburg. Beide haben unterschiedliche Rechtsstellungen und nehmen ihre gemeinsamen Aufgaben in einem Kooperationsmodell wahr. In der Universitätsmedizin Magdeburg sind daher Forschung, Lehre und Krankenversorgung untrennbar miteinander verbunden.