Prof. Reichl
Abgeschlossene Projekte
de.NBI-Partner: MetaProteomanalyzer Service
Laufzeit: 01.11.2016 bis 31.12.2021
Die Metaproteomik zielt auf die Erforschung zellulärer Funktionen komplexer Lebensgemeinschaften und ergänzt die Metagenomik und Metatranscriptomik als häufig eingesetzte Werkzeuge in der mikrobiellen Ökologie. Bioinformatische Werkzeuge, die für die Proteomik von Reinkulturen entwickelt wurden, können nicht zufriedenstellend als Ergebnis benutzt werden. So führen Datenbanksuchen für die Proteinidentifizierung mit Metagenomsequenzen zu einer hohen Zahl redundanten Hits in den Suchergebnissen in Bezug auf Taxonomy und Funktion identifizierter Proteine. Für eine bessere Auswertung von Metaproteomdaten wurde deshalb MetaProteomAnalyzer (MPA) Software entwickelt. Im Rahmen von MetaProtServ soll das benutzerfreundliche Programm mit einer graphischen Oberfläche als Webservice verfügbar gemacht werden, um mehr Wissenschaftler von den Vorteilen der Metaproteomik zu überzeugen. Gezieltes Training von Anwendern und ein individueller Support sollen die Zugänglichkeit dieser Software in der wissenschaftlichen Gemeinschaft erleichtern. Die Funktionalität und die Wartungsfreundlichkeit werden für den zukünftigen Webservice sowie für eine eigenständige Version parallel basierend auf einem gemeinsamen Code und einer gemeinsamen Struktur weiterentwickelt.
Die Projektaktivitäten werden koordiniert von Dr. Dirk Benndorf (https://forschung-sachsen-anhalt.de/pl/benndorf-84560).
Biokatalysatoren in Bioreaktoren: Monitoring, Regelung und multikriterielle Optimierung von Biogasprozessen
Laufzeit: 01.06.2017 bis 30.04.2021
Hauptziel des Vorhabens ist die Charakterisierung der mikrobiellen Stoffwechselaktivitäten in semi-kontinuierlich betriebenen Biogasreaktoren auf Basis vorrangig auftretender mikrobieller Proteine und Enzyme. Die Ergebnisse dieser Studie sollen zur Entwicklung von Strategien zur Unterstützung der Hydrolyse von nachwachsenden Rohstoffen (multikriterielle Optimierung) mittels der gezielten Zugabe von ergänzenden Enzymen pilzlichen Ursprungs komplementär zum bereits vorhandenen endogenen Hydrolysepotenzial dienen. Im Rahmen von Teilvorhaben II erfolgt die systemanalytische Begleitforschung zu den mikrobiellen Stoffwandlungsprozessen der im Teilvorhaben I stattfindenden Fermentationen. Ziel ist die Ermittlung der Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaften auf taxonomischer und funktioneller Ebene, das Monitoring von Veränderungen in der Struktur der mikrobiellen Gemeinschaften während der durchgeführten Fermentationen und der jeweiligen prozesstechnischen Variation sowie die Ermittlung von Veränderungen in der metabolischen Aktivität der mikrobiellen Gemeinschaft. Hierzu soll ein kombinierter Ansatz bestehend aus der kontinuierlichen Erfassung der mikrobiellen Populationsdynamik mittels DNA-basierten TRFLP-Fingerprints und punktuell erfolgender Charakterisierung der Zusammensetzung der mikrobiellen Lebensgemeinschaft und deren metabolischem Potential mittels hochauflösenden und kombinierten OMICS-Technologien angewandt werden. Durch den bioinformatischen Abgleich aller erhaltenen Datensätze soll ein funktionelles Netzwerk der Systemmikrobiologie erstellt werden.
Biogas-Messprogramm III - Teil 2: Systemmikrobiologie; Teilvorhaben 3: Enzymatische Biodiversität
Laufzeit: 01.12.2015 bis 30.11.2019
In Biogasanlagen bewirkt eine komplexe und dynamische mikrobielle Lebensgemeinschaft den anaeroben Aufschluss und Abbau der organischen Biomasse zu energiereichem, methanhaltigem Biogas. Der Großteil der beteiligten Mikroorganismen ist bislang jedoch noch unbekannt, ebenso ihr Einfluss auf die Abbaueffizienz und die Reaktorleistung.
Die in Deutschland betriebenen Biomasse-Biogasanlagen wurden bereits im Rahmen der Biogas-Messprogramme I und II systematisch hinsichtlich Leistung, Funktion, Betriebszuverlässigkeit und Wirtschaftlichkeit untersucht. Jedoch fehlt bislang eine ebenso systematische Erfassung der in Praxis-Biogasanlagen beheimateten Mikroflora.
Im Rahmen des Biogas-Messprogramms III soll daher ein Fokus der Arbeiten auf die Systemmikrobiologie der Biogasanlagen in Deutschland gelegt werden. Ziel ist die Aufklärung des Einflusses abiotischer Prozessparameter auf die mikrobiellen Lebensgemeinschaften in einem Biogasreaktor und deren Stoffwandlungseigenschaften.
Die Projektaktivitäten werden koordiniert von Dr. Dirk Benndorf (https://forschung-sachsen-anhalt.de/pl/benndorf-84560).
e:Bio - Modul II - Verbundprojekt: CellSys - Systembiologischer Ansatz zur Entwicklung einer Produktionszelllinie für Influenzavakzine - Teilprojekt A
Laufzeit: 01.01.2013 bis 31.08.2016
Das Ziel des Verbundprojekts CellSys ist die Optimierung eines zellkulturbasierten Prozesses zur Herstellung von Influenzaimpfstoffen mit Hilfe eines systembiologischen Ansatzes. Dabei sollen Ergebnisse aus der Grundlagenforschung genutzt werden, um die Virusvermehrung in einer humanen Designerzelllinie durch gentechnische Eingriffe gezielt zu steigern und so eine Hochleistungs-Produktionsplattform für Grippeimpfstoffe zu entwickeln.
Prozesskontrolle und Optimierung der Biogasproduktion mittels Metaproteomanalyse
Laufzeit: 01.08.2011 bis 30.07.2014
Die Biogasproduktion in Biogasanlagen ist die viertwichtigste Form der Erzeugung von erneuerbaren Energien in Deutschland. Bei diesem Prozess wandelt eine komplexe mikrobielle Gemeinschaft unter anaeroben Bedingungen Biomasse in Methan um. Das Methan wird anschließend in Blockheizkraftwerken zur Bereitstellung von Strom und Wärme genutzt. Für die effiziente Biogasproduktion sind stabile Wachstumsbedingungen für die mikrobiellen Lebensgemeinschaften in den Biogasanlagen wichtig. Beispielsweise führt eine zu schnelle Freisetzung von organischen Säuren aus dem Substrat zu einem starken Abfall des pH-Wertes und damit zum Absterben der methanogenen Mikroorganismen. Ziel dieses Promotionsvorhabens ist die Entwicklung eines auf Markerproteinen basierenden Schnelltestes, um diese Prozessprobleme rechtzeitig zu erkennen und ihnen entgegenwirken zu können. Zur Suche nach diesen Biomarkern sollen die mikrobiellen Lebensgemeinschaften auf dem Niveau der Proteine mittels Metaproteomeanalyse untersucht werden. Erwartet wird ein neuartiger Einblick in die Black Box der Biogasbildung, zum Beispiel durch die Detektion von Proteinen, die spezifisch für die Hydrolyse der Substrate und die Methanogenese sind. Einige dieser Proteine sollen anschließend als Biomarker für einen semiquantitativen Schnelltest auf immunologischer Basis genutzt werden. Dieser Schnelltest soll vor Ort eingesetzt werden und dem Anlagenbetreiber ermöglichen Prozessinstabilitäten frühzeitig zu erkennen. Dadurch können entsprechende Gegenmaßnahmen rechtzeitig ergriffen und so die Leistung und die Ausbeute der Biogasanlage verbessert werden.
Prozessmikrobiologie in landwirtschaftlichen Biogasanlagen Ermittlung der mikrobiellen Diversität in Biogasanlagen sowie von hauptsächlichen verfahrenstechnischen Einflussfaktoren auf die Mikroflora (BIOGAS-BIOCOENOSIS)
Laufzeit: 01.11.2011 bis 31.10.2013
In Biogasanlagen bewirkt eine komplexe und dynamische mikrobielle Lebensgemeinschaft den Aufschluss und Abbau der organischen Biomasse zu methanhaltigem Biogas. Der Großteil der beteiligten Mikroorganismen ist bislang jedoch noch unbekannt, ebenso ihr Einfluss auf die Reaktoreffizienz. Parallel zu dem bereits durch die FNR geförderten Forschungsvorhabens BiogasEnzyme (FKZ 22027707) soll ein begleitendes Monitoring der Prozessmikrobiologie in ausgewählten landwirtschaftlichen Biogasanlagen stattfinden. Da die meisten der Biogas-Mikroben mittels konventioneller mikrobiologischer Verfahren nicht zu kultivieren sind, sollen vorrangig molekulargenetische Ansätze zur kulturunabhängigen Erfassung der mikrobiellen Diversität auf Basis der Sequenzierung ausgewählter mikrobieller Gene (16S rRNA Gen, mcrA Gen) angewandt werden. Mittels modernster Hochdurchsatz-Technologien wie der 454-Pyrosequenzierung soll ein umfangreicher Datenbestand erarbeitet werden, welche eine Analyse der Auswirkung verschiedener Betriebsweisen von Biogasanlagen auf die Prozessmikrobiologie erlauben. Weiterhin sollen ebenfalls Zusammenhänge zwischen Prozessmikrobiologie sowie Reaktorleistung ermittelt werden. Es wird erwartet, dass sich aus dem Datenmaterial Aussagen über besonders prozessrelevante Arten oder Organismengruppen ableiten lassen, welche als Grundlage für eine weitere biotechnologische Optimierung der Biogasfermentation genutzt werden können.
Analyse von Enzymaktivitäten und Durchführung von Gärversuchen
Laufzeit: 01.12.2012 bis 01.03.2013
Das Ziel des Projektes ist die Entwicklung eines konkreten enzymatischen Verfahrens zur Vorbehandlung von Rübenpressschnitzel-Silage. Dabei sollen Pektine entfernt, und damit die Viskosität des Gärsubstrats verringert werden. Grundlagen des Projekts bilden Laborversuche in Form von Messungen der Enzymaktivität und der Beurteilung des Gärverhaltens.
Kultivierung und Infektion von CAP Zelllinien
Laufzeit: 01.08.2009 bis 15.12.2012
Neu entwickelte humane Suspensionszellen sollen überprüft werden, ob sie als Substrat zur Influenzavirus-Vermehrung dienen können. Dabei soll abgeschätzt werden, ob ein Impfstoff Herstellungsprozess analog zu bestehenden Zellkultur-Prozessen möglich wäre. Dazu wird die Vermehrung verschiedener Influenzaviren unter unterschiedlichen Prozessbedingungen bis zu einem Produktionsmaßstab von 1 L im Bioreaktor getestet.
Einsatz synthetischer Liganden zur Aufreinigung salinsäurehaltiger, rekombinanter humaner Proteine und Impfstoff-Antigene
Laufzeit: 01.10.2008 bis 31.03.2012
Das Projekt hat zum Ziel die Stärkung des Produktionsstandortes in der Biotechnologie sowie die Entwicklung neuer Aufreinigungstechnologien. Unter anderem soll die Entwicklung hochaffiner sialinsäure-spezifischer Liganden zur Aufreinigung rhu-Proteine sowie die Entwicklung hochaffiner kontinuierlicher (SMB) und diskontinuierlicher Trennverfahren für virale Antigene und Influenzaviren und der Ausbau von Ausbildungsmöglichkeiten im Bereich "DSP bilogischer und pharmazeutischer Wirkstoffe" erforscht und verbessert werden.
Dynamics of Influenza A Virus Replication in Epithelial Cells
Laufzeit: 01.01.2007 bis 31.12.2011
Die in höheren Organismen anzutreffende angeborene Immunität stellt bei viraler Infektion eine erste wichtige Verteidigungslinie dar. Für eine effektive Immunabwehr bedarf es vielfältiger intra- und interzellulärer Signalübertragungsmechanismen. Hierbei können infizierte Zellen den kontrollierten Zelltod, auch Apoptose genannt, auslösen, um eine Virusvermehrung zu verhindern. Diese hochkomplexen Mechanismen sind auch in Zellkulturen vorzufinden, die zur Virusimpfstoffproduktion eingesetzt werden. Daher untersuchen wir am Lehrstuhl Bioprozesstechnik, welche der antiviralen Signalübertragungsmechanismen während der Impfstoffproduktion aktiviert werden. Das bessere Verständnis dieser im Bioprozess auftretenden antiviralen Signalwege und der Apoptose soll es ermöglichen, über molekularbiologische Methoden die Impfstoffausbeute zu steigern.
Dynamische Systeme in Biologie / Medizin und Prozesstechnik
Laufzeit: 01.06.2008 bis 31.12.2011
Mammalian cells are of increasing importance as host system for virus replication, e.g. in influenza vaccine production. Fundamental virological and cell biological research is focused on qualitative virus-host cell interactions. However, comparatively little is known about the quantitative aspects of virus replication and the correlated host cell response. In this project, progress of virus infection, extent of influenza virus-induced apoptosis, and impact of cultivation conditions on virus yields are being investigated by flow cytometry in cell cultures. Experimental data sets are used in several collaborations to establish mathematical models describing population dynamics at various levels of complexity.
FORSYS - Systemanalyse von Signal und Regulationsnetzwerken
Laufzeit: 01.01.2007 bis 31.12.2011
Der interdisziplinäre Studiengang Biosystemtechnik an der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg vermittelt den Studenten Wissen aus den Bereichen Ingenieurwissenschaften, Systemwissenschaften, Biologie und Medizin. Diese Ausbildung im Bereich Systembiologie befähigt Absolventen insbesondere zum Umgang mit großen Mengen an biologischen Daten und ihrer Modellierung und eröffnet ihnen Tätigkeitsfelder in Forschung und Industrie.
Im Rahmen der Umstellung des Studienganges von Diplom auf Bachelor und Master soll die Qualität der Ausbildung durch das Angebot veränderter und neuer Lehrveranstaltungen erhöht werden. Das Projekt unterstützt besonders die Durchführung von Laborpraktika in den biologischen Fächern durch die Bereitstellung von Investitionsmitteln für die Ausstattung der Kursräume sowie durch die Finanzierung von Personal zur Durchführung der Kurse (zum Beispiel Mikrobiologie und Cell Culture Engineerring).
Purification and Characterization of Vaccinia virus with special emphasis on MVA-BN®
Laufzeit: 01.03.2007 bis 30.09.2009
Development of an affinity chromatography purification of cell culture derived Vaccinia Virus (VV) after an initial host cell homogenization and clearance centrifugation. The affinity chromatography is based on the interaction between the VV surface protein A27L and heparin, which is currently further characterized by surface plasmon resonance technology. In addition, heparin like molecules are investigated. Moreover, classical ion exchange membrane chromatography and cellufine sulfate with heparin derivatized membrane chromatography are characterized including the removal rate of contaminating host cell proteins and DNA.
Experimentelle Charakterisierung und Dynamik komplexer mikrobieller Gemeinschaften - Wachstumsanalyse einer Modellgemeinschaft mit Relevanz für die klinische Praxis
Laufzeit: 01.10.2005 bis 31.03.2009
Eine medizinisch relevante bakterielle Modellgemeinschaft aus mindestens 3 Spezies soll experimentell untersucht und ihre Wachstumsdynamik mathematisch analysiert werden. Z.B. sollen Konkurrenz oder Kooperation unter den Spezies und wichtige Einflussgrößen des gemeinsamen Wachstums gesucht werden, welche möglicherweise bei Lungeninfektionen eine Rolle spielen. Ein geeignetes mathematisches Modell der Dynamik des heterogenen bakteriellen Systems soll entwickelt werden. Eine eigene molekularbiologische Analysemethode erlaubt die quantitative Überprüfung getroffener Modellannahmen durch Keimzahlbestimmung gemischter Proben. Die quantitative Verifizierung eines Chemostatmodells für 3 Spezies ist unseres Wissens in der Literatur nicht beschrieben und stellt einen hohen Neuigkeitswert dar. Der Einfluss ausgewählter Parameter oder Störgrößen wie z.B. Antibiotika oder Substratwechsel auf die Mischkultur soll in einem computergesteuertem Bioreaktor untersucht werden. Primärziel ist die Etablierung einer reproduzierbaren Mischkultur in einem Gleichgewichtszustand für die weitere Systemanalyse.
Untersuchung des Einflusses von Genregulatorelementen auf die segregationale Plasmidstabilität und Modellierung von rekombinanten Fermentationsprozessen
Laufzeit: 01.01.2006 bis 31.12.2007
- Konstruktion von Plasmiden, die das Human- Interferon gamma-Gen exprimieren und unterschiedlich modifizierte Genregulatorelemente enthalten. Die Plasmide sollen sich durch eine unterschiedliche Transkriptions- und Translationseffektivität des heterologen Gens auszeichnen.
- Durchführung von Batch- und kontinuerlichen Fermentationen zur Ermittlung des Einflusses der Transkriptions- und Translationseffektivität des Human-Interferon gamma - Gens auf die segregationale Stabilität der untersuchten Plasmide.
- Modellierung und Analyse des Fermentationsprozesses zur Produktion von rekombinantem Human-Interferon gamma mit E.coli. Das Modellieren des Fermentationsprozesses sollte eine Grundvoraussetzung für seine Optimierung sein.
- Konstruktion von Expressionsvektoren, die einen erhöhten Ertrag an Human-Interferon gamma im Bioreaktor gewährleisten sollen und sich durch eine hohe segregationale Stabilität auszeichnen.
Charakterisierung eines automatischen, sterilen, totvolumenfreien Probenahme-Moduls für Bioreaktoren
Laufzeit: 01.05.2005 bis 31.01.2006
Probenahme-Sonden sind Teile von manuellen oder automatischen Vorrichtungen zur Probenahme, ohne die Abläufe in Reaktoren nicht umfassend untersucht werden können. In der Fachgruppe Bioprozesstechnik (BPT) am MPI Magdeburg wurde eine Probenahme-Sonde entwickelt und patentiert (WO 2004/033077 A3). Diese erweist sich aus funktionellen und ökonomischen Gründen, wie einfacher Aufbau, Validierbarkeit, unkomplizierte Gestaltung von automatischen Verfahren der Probenahme, als geeignet für die Ausrüstung von Fermentern. Um die Sonde in Fermentersysteme einzugliedern, ist eine eingehende Untersuchung und die Bestimmung von Parametern, wie z.B. Sterilisierbarkeit, Druckstabilität, Förderraten usw. notwendig, die für eine Anwendung als Serienbauteil ausschlaggebend sind. Das Ziel der Arbeit ist ein leistungsfähiges und anwenderfreundliches Produkt.
Plasmidstabilität update
Laufzeit: 01.02.2005 bis 31.12.2005
1. Konstruktion von Plasmiden, die das Human- Interferon gamma Gen exprimieren und unterschiedlich modifizierte Genregulatorelemente enthalten. Die Plasmide sollen sich durch eine unterschiedliche Transkriptions- und Translationseffektivität des heterologen Gens auszeichnen. 2. Durchführung von Batch- und kontinuerlichen Fermentationen zur Ermittlung des Einflusses der Transkriptions- und Translationseffektivität des Human-Interferon gamma Gens auf die segregationale Stabilität der untersuchten Plasmide. 3. Modellierung und Analyse des Fermentationsprozesses zur Produktion von rekombinantem Human-Interferon gamma mit E.coli. Das Modellieren des Fermentationsprozesses sollte eine Grundvoraussetzung für seine Optimierung sein. 4. Konstruktion von Expressionsvektoren, die einen erhöhten Ertrag an Human-Interferon gamma im Bioreaktor gewährleisten sollen und sich durch eine hohe segregationale Stabilität auszeichnen.
Weiterführung der Virusaufreinigung mittels Membranrekuperator
Laufzeit: 01.10.2005 bis 31.12.2005
Aufbauend auf den Ergebnissen einer Studie mit Membranrekuperatoren sollen weiterführende Versuche zur Aufreinigung des Pferde Influenza A NM/1/93 (H3N8) in den Laboratorien des Lehrstuhls Bioprozesstechnik der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg durchgeführt werden. Das Ziel des Projekts ist die weiterführende Machbarkeitsstudie zur Influenzavirusaufreinigung von vorgeklärten Fermentationslösungen mittels Membranrekuperatoren.
Virusaufreinigung mitels Membranrekuperator
Laufzeit: 01.09.2005 bis 30.11.2005
Die Aufreinigung verschiedener Viren mittels Anionenaustausch-Membranchromatographie (AExMCh) ist mehrfach gezeigt worden und findet kommerziellen Einsatz in Kits. Ergebnisse von Aufreinigungsstudien mit Ionenaustauschermembranen zeigen, dass sich die Membranchromatographie von der herkömmlichen Säulenchromatographie durch höhere Bindungskapazitäten, höhere Wiederfindungsraten und erhöhtem Durchsatz unterscheidet. In der Säulenchromatographie gibt es etablierte Systeme wie z. B. die Expanded Bed Chromatographie (EBA), die auch mit ungeklärten Fermentationslösungen beaufschlagt werden können. Diese werden mit Erfolg, z.B. für die Proteinaufreinigung, eingesetzt.Ziel dieser Arbeit ist der Test von einem neuartigen Membran-Chromatographiesystem (Rekuperator), zur Konzentrierung und begrenzten Aufreinigung von Influenza A PR/8/34 (H1N1) aus geklärten Fermentationsbrühen. Abhängig von den Ergebnissen der Versuchsreihen können in einem Folgeversuch ungeklärte Fermentationsbrühen getestet werden.
Optimierungsstudie: Charakterisierung und Optimierung der MVA Vermehrung in primären HEF zur Herstellung von Impfstoffen
Laufzeit: 15.06.2004 bis 15.06.2005
Optimierungsstudie: Charakterisierung und Optimierung der Vermehrung von Vaccina Viren in primären Hühnerembryo Fibroblasten (HEF) zur Herstellung von rekombinanten Impfstoffen. Weitere Kurzbeschreibungen fehlen.
Entwicklung eines Microcarrier-basierten Herstellungsverfahrens für einen Impfstoff gegen Schweine-Influenza
Laufzeit: 01.10.2004 bis 30.05.2005
Ein Verfahren zur Vermehrung von MDBK-Zellen auf Microcarriern (Cytodex1, Cytodex 3, …) im Maßstab von 0.5-1.0 L soll etabliert und die Vermehrung des Schweine-Influenza-Virus auf diesem System optimiert werden. Dem Kulturmedium wird tierisches Serum zugesetzt, um die Anheftung der Zellen und damit die Verfahrensentwicklung zu vereinfachen. Das langfristige Ziel, ggf. in einem Folgeprojekt, ist die Entwicklung eines serumfreien Kultivierungsverfahrens.
Bioreaktor mit Sensorik
Laufzeit: 01.10.2004 bis 31.12.2004
Anwendungsnahes Forschungsvorhaben im Bereich Zellkulturtechnologie zur Entwicklung und Optimierung von Prozessen zur Herstellung von innovativen Impfstoffen, viralen Vektoren, Antigenen und rekombinanten Proteinen.
Downstream Processing of Viral Vaccines
Laufzeit: 01.06.2004 bis 30.11.2004
The project focuses on chromatographic methods (size exclusion, anion exchange). Inactivated antigen for parallel investigations using different matrices or operating conditions is produced in roller bottles (1-2 L wv) and microcarrier bioreactors (2.5-4 L wv). Chromatography media will be tested in group separation mode to remove bulk protein from the virus. The objective is to maximize purity, viral yield, throughput and cycle times. Ion exchange chromatography will be operated in negative mode (virus in flow-through). Negatively charged species (mainly nucleic acids) are to be retained by the matrix. The aim is a high reduction in host cell DNA (below detection limit) combined with high recovery of the virus.
Evaluation of membrane techniques in downstream processing of influenza virus
Laufzeit: 01.08.2004 bis 30.11.2004
Use of cross flow microfiltration to replace current depth filtration and ultrafiltration methods in downstream processing of inactivated vaccines. The purpose of the microfiltration step is the removal of contaminants that can pass through the membrane pores, buffer exchange (e.g. low salt buffer) and concentration of the virus particles. The effect of membrane pore sizes on virus retention and contaminant removal will be determined. A range of operating conditions (feed flow/wall shear rates, transmembrane pressure drops) and their influence on processing time, membrane fouling, recovery, etc. will be investigated. In addition a comparison of ion exchange membranes and resins will be conducted in order to compare the performance of ion exchange membranes and resin for virus purification. The performance of membranes and resins will beevaluated by determining breakthrough curves (dynamic capacities), adsorption isotherms, resolution and viral recovery. The results obtained for ion exchange resins and membranes will be compared to results obtained for downstream processing steps currently in use.
Entwicklung und Erprobung von Prozessführungskonzepten zur Herstellung von inaktivierten Virusimpfstoffen
Laufzeit: 01.06.2001 bis 31.05.2004
On-line Datenerfassung: Entwicklung einer Probenahmeapparatur, die es ermöglicht, kontinuierlich und totvolumenfrei, Proben aus Bioreaktoren zu entnehmen. Prozessüberwachung: Zur Kontrolle der wichtigsten Stoffwechselmetabolite tierischer Zellen. Mathematische Modellierung: Die Herstellung von Impfstoffen in tierischen Zellen geschieht in der Regel in einem zweistufigen Prozess - auf einen Scale-up zur Zellvermehrung folgt die Infektion mit anschließender Virusvermehrung. Im Rahmen des Projektes wurden zunächst umfangreiche Arbeiten zur quantitativen Analyse des Infektionsvorganges durchgeführt. Es wurde ein grundlegendes mathematisches Modell entwickelt, das es gestattet, die Population von uninfizierten Zellen, infizierten Zellen und freigesetzten Viren quantitativ zu beschreiben und Simulationen zur Analyse derjenigen Parameter, die im wesentlichen die Ausbeute von Impfstoffpozessen bestimmen, durchzuführen.
Entwicklung eines Verfahrens für die großtechnische Herstellung von rekombinanten MVA als AIDS Vakzine in permanenten Hühnerembryofibroblasten
Laufzeit: 01.04.2003 bis 31.01.2004
Für den Einsatz als AIDS-Impfstoff wurde ein rekombinantes Vaccina Virus (MVA) entwickelt, das sich in der klinischen Prüfung Phase II befindet. Als Kultivationssubstrat für MVA dienen primäre Hühnerembryo Fibroblasten (HEF). In der ersten Phase muss für die permanente HEF zunächst im kleinen Maßstab (Zellkulturflasche z.B. T 25) ein geeignetes Kulturmedium gefunden werden, in dem die Parameter für Wachstum, zusätzlich Stoffwechsel und ggf. Anheftung der Zellen an Microcarrier in einem optimalen Bereich liegen. In geeigneten Medien wird die Virusvermehrung orientierend geprüft. Im weiteren Verlauf werden im 0,5-1L Maßstab (Sixfors-Kleinfermenter, WAVE-Reaktor) Stoffwechsel, Wachstum der Zellen mit und ohne Microcarrier und Virusvermehrung in einem Kulturmedium charakterisiert und verglichen. Das hinsichtlich Zellwachstum und Virusproduktion optimierte Verfahren wird anschließend in einen größeren Maßstab (5L Rührreaktor, WAVE) übertragen.
Entwicklung eines serumfreien Kultivierungsverfahrens von primären Hühnerembryofibroblasten auf Microcarriern
Laufzeit: 01.02.2002 bis 31.12.2003
Primäre Hühnerembryofibroblasten (HEF) dienen als sicheres und effizientes Kultivationssubstrat zur Herstellung einer Reihe veterinärmedizinischer und humanmedizinischer Impfstoffe.Standardverfahren ist derzeit die Kultivierung in der Rollerflasche. Für eine großtechnische Zellkultivierung sind dabei mit hohem personellen und manuellen Aufwand große Stückzahlen von Rollerflaschen zu bearbeiten. Außerdem werden erhebliche Produktionslaborkapazitäten benötigt und die Handhabung einer Vielzahl von Kultivationsbehältnissen vergrößert das Kontaminationsrisiko.Ziel dieses Projektes ist, ein Verfahren zur Kultivierung von primären HEF auf Microcarriern zu etablieren.Die adhärente Zelllinie soll großtechnisch unter serumfreien Bedingungen in Bioreaktoren oder in WAVE® Systemen vermehrt werden. Anschließend sollen beide Kultursysteme hinsichtlich Virusausbeuten verglichen werden.
Entwicklung eines Herstellungsverfahrens für einen Impfstoff gegen Nerzenteritis
Laufzeit: 01.09.2002 bis 31.10.2003
Die E-FL Zelle dient als Kultivationssubstrat zur Vermehrung von Mink Enteritis Virus. Standardverfahren ist derzeit die Kultivierung in der Rollerflasche. Für eine großtechnische Zellkultivierung sind dabei mit hohem personellen und manuellen Aufwand große Stückzahlen von Rollerflaschen zu bearbeiten. Außerdem werden erhebliche Produktionslaborkapazitäten benötigt.Weiterhin ist die Vermehrung des Nerz Enteritis Virus biologisch direkt an die Zellvermehrung gebunden und deshalb relativ kompliziert zu optimieren.Ziel dieses Projektes ist, ein Verfahren zur Vermehrung von E-FL Zellen auf Microcarriern zu etablieren und die Virusvermehrung auf diesem System zu optimieren.Die adhärente Zelllinie soll großtechnisch in Fermentoren oder in WAVE® Systemen vermehrt werden. Weiterhin wird in diesen Systemen die Optimierung der Virusvermehrung geprüft.
2025
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Influenza A virus production following quality by design principles
Zinnecker, Tilia; Thiele, Kristin; Schmidberger, Timo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 25 (2025), Heft 4, insges. 11 S.
Seed train intensification and TFDF-based perfusion for MDCK cell-based influenza a virus production
Zinnecker, Tilia; Wicke, Emelie; Reichl, Udo; Göbel, Sven; Genzel, Yvonne
In: Processes - Basel : MDPI, Bd. 13 (2025), Heft 5, Artikel 1286, insges. 21 S.
Process intensification for recombinant Marburg virus glycoprotein production using drosophila S2 cells
Göbel, Sven; Mayerlen, Ludwig; Eiser, Isabelle Yazel; Fichtmueller, Lisa; Clements, David; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne; Lehrer, Axel T.
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 25 (2025), Heft 5, Artikel e70022, insges. 13 S.
Quantification of intracellular influenza A virus protein dynamics in different host cells after seed virus adaptation
Küchler, Jan; Opitz, Patricia; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 109 (2025), Artikel 74, insges. 17 S.
Fecal metaproteomics enables functional characterization of remission in patients with inflammatory bowel disease
Wolf, Maximilian; Lange, Julian; Benndorf, Dirk; Welz, Lina; Nikolaus, Susanna; Siever, Laura Katharina; Tran, Florian; Schallert, Kay; Hellwig, Patrick; Schreiber, Stefan; Gunzer, Matthias; Rosenstiel, Philip; Reichl, Udo; Adolph, Timon; Jukic, Almina; Aden, Konrad; Heyer, Robert
In: Journal of proteomics - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 318 (2025), S. 1-11, Artikel 105455, 1 Online-Ressource (11 Seiten)
2024
Aufsatz
Improved biological methanation using tubular foam-bed reactor
Khesali Aghtaei, Hoda; Hyer, Robert; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Biotechnology for biofuels and bioproducts - London : BioMed Central, Bd. 17 (2024), Artikel 66, insges. 12 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Production of antiviral “OP7 chimera” defective interfering particles free of infectious virus
Pelz, Lars; Dogra, Tanya; Marichal-Gallardo, Pavel; Hein, Marc Dominique; Hemissi, Ghada; Kupke, Sascha Young; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 108 (2024), Artikel 97, insges. 15 S.
Breakdown of hardly degradable carbohydrates (lignocellulose) in a two-stage anaerobic digestion plant is favored in the main fermenter
Heyer, Robert; Hellwig, Patrick; Maus, Irena; Walke, Danile; Schlüter, Andreas; Hassa, Julia; Sczyrba, Alexander; Tubbesing, Tom; Klocke, Michael; Mächtig, Torsten; Schallert, Kay; Seick, Ingolf; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Water research - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science, Bd. 250 (2024), Artikel 121020, insges. 11 S.
Model-based optimization of cell-free enzyme cascades exemplified for the production of GDP-fucose
Huber, Nicolas; Alcalá-Orozco, Edgar Alberto; Rexer, Thomas; Reichl, Udo; Klamt, Steffen
In: Metabolic engineering - Orlando, Fla. : Academic Press, Bd. 81 (2024), S. 10-25
From single-cell cloning to high-yield influenza virus production - implementing advanced technologies in vaccine process development
Zinnecker, Tilia; Badri, Najd; Araujo, Diogo; Thiele, Kristin; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH . - 2024, insges. 14 S. [Online first]
Production of recombinant vesicular stomatitis virus-based vectors by tangential flow depth filtration
Göbel, Sven; Pelz, Lars; Silva, Cristina A. T.; Brühlmann, Béla; Hill, Charles; Altomonte, Jennifer; Kamen, Amine; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 108 (2024), Artikel 240, insges. 18 S.
Mathematical model calibrated to in vitro data predicts mechanisms of antiviral action of the influenza defective interfering particle "OP7"
Rüdiger, Daniel; Piasecka, Julita; Küchler, Jan; Pontes, Carolina; Laske, Tanja; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo
In: iScience - Amsterdam : Elsevier, Bd. 27 (2024), Heft 4, Artikel 109421, insges. 22 S.
Macrophage- and CD4+ T cell-derived SIV differ in glycosylation, infectivity and neutralization sensitivity
Karsten, Christina B.; Büttner, Falk; Cajic, Samanta; Nehlmeier, Inga; Roshani, Berit; Klippert, Antonina; Sauermann, Ulrike; Stolte-Leeb, Nicole; Reichl, Udo; Gerardy-Schahn, Rita; Rapp, Erdmann; Stahl-Hennig, Christine
In: PLoS pathogens / Public Library of Science - Lawrence, Kan. : PLoS, Bd. 20 (2024), Heft 5, Artikel e1012190, insges. 20 S.
Parallel multifactorial process optimization and intensification for high-yield production of Live YF17D-vectored zika vaccine
Göbel, Sven; Kazemi, Ozeir; Ma, Ji; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Paulissen, Jasmine; Kerstens, Winnie; Thibaut, Hendrik Jan; Reichl, Udo; Dallmeier, Kai; Genzel, Yvonne
In: Vaccines - Basel : MDPI, Bd. 12 (2024), Heft 7, Artikel 755, insges. 23 S.
Innovations in cell culture-based influenza vaccine manufacturing – from static cultures to high cell density cultivations
Zinnecker, Tilia; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Human vaccines & immunotherapeutics - Austin, Tex. : Landes Bioscience, Bd. 20 (2024), Heft 1, insges. 15 S.
Tracing active members in microbial communities by BONCAT and click chemistry-based enrichment of newly synthesised proteins
Hellwig, Patrick; Kautzner, Daniel; Heyer, Robert; Dittrich, Anna; Wibberg, Daniel; Busche, Tobias; Winkler, Anika; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: ISME communications - Oxford : Oxford University Press, Bd. 4 (2024), Heft 1, Artikel ycae153, insges. 14 S.
Dissertation
In-depth characterization and cell culture-based production in influenza A virus defective interfering particles
Pelz, Lars; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2024, 1 Online-Ressource (Verschiedene Seitenzählungen, 13.32 MB) [Literaturangaben][Literaturangaben]
2023
Abstract
Adjuvanted SARS-CoV-2 spike protein vaccination with altered glycosylation elicits improved TH1 humoral and cellular immunity in mice
Rudert, J.; Bälkner, M.; Juarez-Osorio, M.; Rexer, T.; Reichl, Udo; Jacobsen, H.; Metzdorf, K.; Bruder, D.; Volckmar, J.
In: European journal of immunology - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 53 (2023), Heft S2, S. 358, Artikel P376 [Konferenz: Joint Conference of the Société Française d'Immunologie (SFI) and the Deutsche Gesellschaft für Immunologie (DGfI), Strasbourg, France, 26-29 September 2023]
Aufsatz
Degradation kinetics of lignocellulolytic enzymes in a biogas reactor using quantitative mass spectrometry
Küchler, Jan; Willenbücher, Katharina; Reiß, Elisabeth; Nuß, Lea; Conrady, Marius; Ramm, Patrice; Schimpf, Ulrike; Reichl, Udo; Szewzyk, Ulrich; Benndorf, Dirk
In: Fermentation - Basel : MDPI, Bd. 9 (2023), Heft 1, Artikel 67, 1 Online-Ressource (12 Seiten)
Buchbeitrag
Upstream processing for viral vaccines - process intensification
Göbel, Sven; Pelz, Lars; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Bioprocessing of viral vaccines , First edition - Abgingdon : Taylor & Francis ; Kamen, Amine . - 2023, S. 137-173
Upstream processing for viral vaccines - general aspects
Pelz, Lars; Göbel, Sven; Jaen, Karim; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Bioprocessing of viral vaccines , First edition - Abgingdon : Taylor & Francis ; Kamen, Amine . - 2023, S. 79-135
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Process intensification strategies toward cell culture-based high-yield production of a fusogenic oncolytic virus
Göbel, Sven; Jaén, Karim E.; Dorn, Marie; Neumeyer, Victoria; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Altomonte, Jennifer; Genzel, Yvonne
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley . - 2023, insges. 19 S.
Broad-spectrum antiviral activity of influenza A Defective Interfering Particles against respiratory syncytial, yellow fever, and Zika virus replication in vitro
Pelz, Lars; Piagnani, Elena; Marsall, Patrick; Wynserski, Nancy; Hein, Marc Dominique; Marichal-Gallardo, Pavel; Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo
In: Viruses - Basel : MDPI, Bd. 15 (2023), Heft 9, Artikel 1872, insges. 17 S.
Cell-free biosynthesis meets dynamic optimization and control - a fed-batch framework
Espinel-Ríos, Sebastián; Huber, Nicolas; Alcalá-Orozco, Edgar Alberto; Morabito, Bruno; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo; Klamt, Steffen; Findeisen, Rolf
In: IFAC-PapersOnLine / Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt : Elsevier, Bd. 55 (2022), Heft 23, S. 92-97
Cell-free N-glycosylation of peptides using synthetic lipid-linked hybrid and complex N-glycans
Wenzel, Lisa; Hoffmann, Marcus; Rapp, Erdmann; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo
In: Frontiers in molecular biosciences - Lausanne : Frontiers, Bd. 10 (2023), insges. 11 S.
Characterization of a quail suspension cell line for production of a fusogenic oncolytic virus
Göbel, Sven; Jaén, Karim E.; Fernandes, Rita P.; Reiter, Manfred; Altomonte, Jennifer; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley . - 2023, insges. 12 S. [Early view]
A cell-free multi-enzyme cascade reaction for the synthesis of CDP-glycerol
Alcalá-Orozco, E. Alberto; Grote, Valerian; Fiebig, Timm; Klamt, Steffen; Reichl, Udo; Rexer, Thomas
In: ChemBioChem - Weinheim : Wiley-VCH . - 2023, Artikel e202300463 [Early view]
Generation of "OP7 chimera" defective interfering influenza A particle preparations free of infectious virus that show antiviral efficacy in mice
Dogra, Tanya; Pelz, Lars; Boehme, Julia D.; Kuechler, Jan; Kershaw, Olivia; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Baelkner, Maike; Hein, Marc Dominique; Gruber, Achim; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Bruder, Dunja; Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo
In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature, Bd. 13 (2023), Artikel 20936, insges. 13 S.
Production of retroviral vectors in continuous high cell density culture
Hein, Marc D.; Kazenmaier, Daniel; van Heuvel, Yasemin; Dogra, Tanya; Cattaneo, Maurizio; Kupke, Sascha Y.; Stitz, Jörn; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 107 (2023), S. 5947-5961
Removable Ddes - the missing link for in-depth N-glycan analysis via multi-method approaches
Cajic, Samanta; Hennig, René; Grote, Valerian; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Engineering - Beijing : Engineering Sciences Press., Bd. 26 (2023), S. 132-150
Reliable N-glycan analysis - removal of frequently occurring oligosaccharide impurities by enzymatic degradation
Burock, Robert; Cajic, Samanta; Henning, René; Buettner, Falk, F. R.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Molecules - Basel : MDPI, Bd. 28 (2023), Heft 4, Artikel 1843, insges. 19 S.
2022
Aufsatz
Absolute quantification of viral proteins during single-round replication of MDCK suspension cells
Küchler, Jan; Püttker, Sebastian; Lahmann, Patrick; Genzel, Yvonne; Kupke, Sascha; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo
In: Journal of proteomics - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 259 (2022), Artikel 104544, insges. 10 S.
Adaptation of a microbial community to demand-oriented biological methanation
Khesali Aghtaei, Hoda; Püttker, Sebastian; Maus, Irena; Heyer, Robert; Huang, Liren; Sczyrba, Alexander; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Biotechnology for biofuels and bioproducts - London : BioMed Central, Bd. 15 (2022), Heft 1, Artikel 125, 1 Online-Ressource (19 Seiten)
Buchbeitrag
Discovering biomarkers for non-alcoholic steatohepatitis patients with and without hepatocellular carcinoma using fecal metaproteomics
Sydor, Svenja; Dandyk, Christian; Schwerdt, Johannes; Manka, Paul; Benndorf, Dirk; Lehmann, Theresa; Schallert, Kay; Wolf, Maximilian; Reichl, Udo; Canbay, Ali E.; Bechmann, Lars P.; Heyer, Robert
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 23 (2022), Heft 16, Artikel 8841, insges. 14 S.
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Cell-line screening and process development for a fusogenic oncolytic virus in small-scale suspension cultures
Göbel, Sven; Kortum, Fabian; Chavez, Karim Jaén; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Altomonte, Jennifer; Genzel, Yvonne
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 106 (2022), Heft 13/16, S. 4945-4961
Human 3D airway tissue models for real-time microscopy - visualizing respiratory virus spreading
Möckel, Marion; Baldok, Nino; Walles, Thorsten; Hartig, Roland; Müller, Andreas Johann; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne; Walles, Heike; Wiese-Rischke, Cornelia
In: Cells - Basel : MDPI, Bd. 11 (2022), Heft 22, Artikel 3634, insges. 21 S.
Impact of influenza A virus infection on growth and metabolism of suspension MDCK cells using a dynamic model
Ramos, João Rodrigues Correia; Bissinger, Thomas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Metabolites - Basel : MDPI, Bd. 12 (2022), Heft 3, Artikel 239, insges. 27 S.
High-titer hepatitis C virus production in a scalable single-use high cell density bioreactor
Offersgaard, Anna; Duarte Hernandez, Carlos Rene; Pihl, Anne Finne; Venkatesan, Nadini Prabhakar; Krarup, Henrik; Lin, Xiangliang; Reichl, Udo; Bukh, Jens; Genzel, Yvonnne; Gottwein, Judith Margarete
In: Vaccines - Basel : MDPI, Bd. 10 (2022), Heft 2, Artikel 249, insges. 24 S.
Dissertation
Mathematical models of influenza A virus infection - multiplicity of infection and its impact on co-infection and virus production
Rüdiger, Daniel; Tsotsas, Evangelos; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2022, 1 Online-Ressource (XVIII, 179 Seiten, 8,16 MB), Illustrationen
Cell culture-based production of influenza A virus-derived defective interfering particles
Hein, Marc Dominique; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2022, 1 Online-Ressource (XV, 98, XVII-L Seiten, 5,1 MB) [Literaturverzeichnis: Seite XX-XXXVII]
Development of chromatography-based purification processes for cell culture-derived influenza virus particles
Weigel, Thomas; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2022, 1 Online-Ressource (XXII, 145 Seiten, 2,22 MB) [Literaturverzeichnis: Seite 119-133]
2021
Aufsatz
MPA_Pathway_Tool - user-friendly, automatic assignment of microbial community data on metabolic pathways
Walke, Daniel; Schallert, Kay; Ramesh, Prasanna; Benndorf, Dirk; Lange, Emanuel; Reichl, Udo; Heyer, Robert
In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 22 (2021), Heft 20, Artikel 10992, insges. 12 S.
Critical Assessment of MetaProteome Investigation (CAMPI) - a multi-laboratory comparison of established workflows
Van Den Bossche, Tim; Kunath, Benoit J.; Schallert, Kay; Schäpe, Stephanie S.; Abraham, Paul C.; Armengaud, Jean; Arntzen, Magnus Ø.; Bassignani, Ariane; Benndorf, Dirk; Fuchs, Steohan; Giannone, Richard J.; Griffin, Timothy J.; Hagen, Live H.; Halder, Rashi; Henry, Céline; Hettich, Robert L.; Heyer, Robert; Jagtap, Pratik; Jehmlich, Nico; Jensen, Marlene; Juste, Ctherine; Kleiner, Manuel; Langella, Olivier; Lehmann, Theresa; Leith, Emma; May, Patrick; Mesuere, Bart; Miotello, Guylaine; Peters, Samantha L.; Pible, Olivier; Queiros, Pedro T.; Reichl, Udo; Renard, Bernhard Y.; Schiebenhoefer, Henning; Sczyrba, Alexander; Tanca, Alessandro; Trappe, Kathrin; Trezzi, jean-Pierre; Uzzau, Sergio; Verschaffelt, Pieter; Bergen, Martin von; Wilmes, Paul; Wolf, Maximilian; Martens, Lennart; Muth, Thilo
In: Nature Communications - [London] : Nature Publishing Group UK, Bd. 12 (2021), S. 1-15, Artikel 7305
Fecal metaproteomics reveals reduced gut inflammation and changed microbial metabolism following lifestyle-induced weight loss
Biemann, Ronald; Buß, Enrico; Benndorf, Dirk; Lehmann, Theresa; Schallert, Kay; Püttker, Sebastian; Reichl, Udo; Isermann, Berend; Schneider, Jochen; Saake, Gunter; Heyer, Robert
In: Biomolecules - Basel : MDPI - Vol.11.2021, 5, 726, insgesamt 13 Seiten
Tracking changes in adaptation to suspension growth for MDCK cells: cell growth correlates with levels of metabolites, enzymes and proteins
Pech, Sabine; Rehberg, Markus; Janke, Robert; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Muth, Thilo; Sickmann, Albert; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 105 (2021), S. 1861-1874
OP7, a novel influenza A virus defective interfering particle - production, purification, and animal experiments demonstrating antiviral potential
Hein, Marc D.; Kollmus, Heike; Marichal-Gallardo, Pavel; Püttker, Sebastian; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Schughart, Klaus; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 105 (2021), Heft 1, S. 129-146
Buchbeitrag
Correction to: Animal Cell Expression Systems
Butler, M.; Reichl, Udo
In: Advances in Glycobiotechnology - Cham: Springer International Publishing; Rapp, Erdmann . - 2021, S. 459-461
Preface
Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Advances in Glycobiotechnology - Cham: Springer International Publishing; Rapp, Erdmann . - 2021, S. v-vi
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Continuous purification of influenza A virus particles using pseudo-affinity membrane chromatography
Fortuna, Raquel A.; Taft, Florian; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 342 (2021), S. 139-148
Integrated cycles for urban biomass as a strategy to promote a CO2-neutral society - a feasibility study
Meinusch, Nicole; Kramer, Susanne; Körner, Oliver; Wiese, Jürgen; Seick, Ingolf; Beblek, Anita; Berges, Regine; Illenberger, Bernhard; Illenberger, Marco; Uebbing, Jennifer; Wolf, Maximilian; Saake, Gunter; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Heyer, Robert
In: Sustainability - Basel : MDPI, Bd. 13 (2021), Heft 17, Artikel 9505, insges. 22 S.
Associated viral gene transfer vectors by membrane-based steric exclusion chromatography
Marichal-Gallardo, Pavel; Börner, Kathleen; Pieler, Michael M.; Sonntag-Buck, Vera; Obr, Martin; Bejarano, David; Wolff, Michael W.; Kräusslich, Hans-Georg; Reichl, Udo; Grimm, Dirk
In: Human gene therapy - New York, NY: Liebert, 2021, insgesamt 16 Seiten
Multienzyme cascades for the in vitro synthesis of guanosine diphosphate Lfucose
Mahour, Reza; Marichal-Gallardo, Pavel A.; Rexer, Thomas; Reichl, Udo
In: ChemCatChem - Weinheim: WILEY-VCH Verlag, Bd. 13 (2021), insges. 11 S.
Cell culture-based production of defective interfering influenza A virus particles in perfusion mode using an alternating tangential flow filtration system
Hein, Marc D.; Chawla, Anshika; Cattaneo, Maurizio; Kupke, Sascha Y.; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 105 (2021), S. 7251–7264
Towards integrated production of an influenza A vaccine candidate with MDCK suspension cells
Bissinger, Thomas; Wu, Yixiao; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Riedel, Dietmar; Liu, Xuping; Genzel, Yvonne; Tan, Wen-Song; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, Bd. 118 (2021), 10, S. 3996-4013
High cell density perfusion process for high yield of influenza A virus production using MDCK suspension cells
Wu, Yixiao; Bissinger, Thomas; Genzel, Yvonne; Liu, Xuping; Reichl, Udo; Tan, Wen-Song
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 105 (2021), 4, S. 1421-1434
SARS-CoV-2 production in a scalable high cell density bioreactor
Offersgaard, Anna; Duarte Hernandez, Carlos Rene; Pihl, Anne Finne; Costa, Rui; Venkatesan, Nandine Prabhakar; Lin, Xiangliang; Pham, Long Van; Feng, Shan; Fahnøe, Ulrik; Scheel, Troels Kasper Høyer; Ramirez, Santseharay; Reichl, Udo; Bukh, Jens; Genzel, Yvonne; Gottwein, Judith Margarete
In: Vaccines - Basel: MDPI, Bd. 9 (2021), 7
Site-specific N-glycosylation analysis of animal cell culture-derived Zika virus proteins
Pralow, Alexander; Nikolay, Alexander; Leon, Arnaud; Genzel, Yvonne; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature, Bd. 11 (2021), Artikel 5147
Cell-free multi-enzyme synthesis and purification of uridine diphosphate galactose
Mahour, Reza; Lee, Ju Weon; Grimpe, Pia; Boecker, Simon; Grote, Valerian; Klamt, Steffen; Seidel-Morgenstern, Andreas; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo
In: ChemBioChem - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 22 (2021), S. 1-11
Combining functional metagenomics and glycoanalytics to identify enzymes that facilitate structural characterization of sulfated N-glycans
Chuzel, Léa; Fossa, Samantha L.; Boisvert, Madison L.; Cajic, Samanta; Heenig, René; Ganatra, Mehul B.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Taron, Christopher H.
In: Microbial cell factories - London : Biomed Central, Bd. 20 (2021), S. 1-17, Artikel 162
Semi-continuous propagation of influenza A virus and its defective interfering particles - analyzing the dynamic competition to select candidates for antiviral therapy
Pelz, Lars; Rüdiger, Daniel; Dogra, Tanya; Alnaji, Fadi G.; Genzel, Yvonne; Brooke, Christopher B.; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo
In: Journal of virology - Baltimore, Md.: Soc., Bd. 95 (2021), 24, insges. 18 S.
Comprehensive N‐glycosylation analysis of the influenza A virus proteins HA and NA from adherent and suspension MDCK cells
Pralow, Alexander; Hoffmann, Marcus; Nguyen-Khuong, Terry; Pioch, Markus; Hennig, René; Genzel, Yvonne; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: The FEBS journal / Vereinigung der Europäischen Biochemischen Gesellschaften - Oxford [u.a.] : Wiley-Blackwell, Bd. 288 (2021), Heft 16, S. 4869-4891
Forschungsarbeiten am Institut für Verfahrenstechnik der OttovonGuerickeUniversität Magdeburg
Reichl, Udo; Seidel-Morgenstern, Andreas; Sundmacher, Kai; Tsotsas, Evangelos; Wachem, Berend
In: Chemie - Ingenieur - Technik - Weinheim : Wiley-VCH Verl., Bd. 93 (2021), Heft 3, S. 345-352
Antiviral activity of influenza A virus defective interfering particles against SARS-CoV-2 replication in vitro through stimulation of innate immunity
Rand, Ulfert; Kupke, Sascha Young; Shkarlet, Hanna; Hein, Marc Dominique; Hirsch, Tatjana; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Cicin-Sain, Luka; Reichl, Udo; Bruder, Dunja
In: Cells - Basel: MDPI, 2012, Bd. 10 (2021), 7, insges. 14 S.
Cell-free glycoengineering of the recombinant SARS-CoV-2 spike glycoprotein
Ruhnau, Johannes; Grote, Valerian; Juarez-Osorio, Mariana; Bruder, Dunja; Mahour, Reza; Rapp, Erdmann; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo
In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, 2013, Bd. 9 (2021), insges. 10 S.
A high cell density perfusion process for Modified Vaccinia virus Ankara production - process integration with inline DNA digestion and cost analysis
Gränicher, Gwendal; Babakhani, Masoud; Göbel, Sven; Jordan, Ingo; Marichal-Gallardo, Pavel; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley . - 2021, insges. 15 S.
Multiscale model of defective interfering particle replication for influenza A virus infection in animal cell culture
Rüdiger, Daniel; Pelz, Lars; Hein, Marc D.; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo
In: PLoS Computational Biology/ Public Library of Science - San Francisco, Calif.: Public Library of Science, Bd. 17 (2021), 9, insges. 28 S.
Cell culture-based production and in vivo characterization of purely clonal defective interfering influenza virus particles
Hein, Marc D.; Arora, Prerna; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Winkler, Michael; Genzel, Yvonne; Pöhlmann, Stefan; Schughart, Klaus; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo
In: BMC biology - Berlin: Springer, Bd. 19 (2021)
Dissertation
Scalable multi-enzyme platforms for the in vitro glycoengineering of therapeutic proteins & synthesis of human milk oligosaccharides
Mahour, Reza; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2022, 1 Online-Ressource (XV, 170 Blätter, 5,8 MB), Illustrationen
Process intensification and integration for the production of vaccines and viral vectors
Gränicher, Gwendal; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XXX, 222 Seiten, 8,49 MB), Illustrationen, Diagramme
Process intensification for the production of MVA and influenza A virus in high density suspension cultures of AGE1.CR.pIX cells
Vázquez Ramírez, Daniel; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XIV, 136 Seiten, 7,58 MB), Illustrationen
Metaproteomanalyse methanogener Mikrobiome aus Anreicherungskulturen im Labormaßstab
Kohrs, Fabian; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (IX, 123, A-J Seiten, 3,84 MB), Illustrationen
Application of functional metagenomics to the field of glycobiology
Chuzel, Léa; Reichl, Udo
In: Düren: Shaker Verlag, 2022, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2021, XI, 229 Seiten - (Forschungsberichte aus dem Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme; Band 55), ISBN: 3-8440-8437-1 [Literaturverzeichnis: Seite 186-210]
Mathematical models of influenza A virus infection - elucidating the impact of host cell factors and defective interfering particles on virus growth
Laske, Tanja; Sundmacher, Kai; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XVIII, 233 Seiten, 17,07 MB), Illustrationen, Diagramme
Herausgeberschaft
Advances in glycobiotechnology
Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Cham: Springer, 2021, viii, 461 Seiten - (Advances in biochemical engineering/biotechnology; 175), ISBN: 978-3-030-69589-7 [Literaturangaben]
2020
Artikel in Zeitschrift
Synthesis of lipid-linked oligosaccharides by a compartmentalized multi-enzyme cascade for the in vitro N-glycosylation of peptides
Rexer, Thomas F. T.; Wenzel, Lisa; Hoffmann, Marcus; Tischlik, Sebastian; Bergmann, Christin; Grote, Valerian; Boecker, Simon Matthias; Bettenbrock, Katja; Schildbach, Anna; Kottler, Robert; Mahour, Reza; Rapp, Erdmann; Pietzsch, Markus; Reichl, Udo
In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 322 (2020), S. 54-65
Buchbeitrag
Perfusion control for high cell density cultivation and viral vaccine production
Nikolay, Alexander; Bissinger, Thomas; Gränicher, Gwendal; Wu, Yixiao; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Animal Cell Biotechnology: Methods and Protocols - New York, NY: Springer US; Pörtner, Ralf . - 2020, S. 141-168
Impact of feeding and stirring regimes on the internal stratification of microbial communities in the fermenter of anaerobic digestion plants
Heyer, Robert; Klang, Johanna; Hellwig, Patrick; Schallert, Kay; Kress, Philipp; Hülsemann, Benedikt; Theuerl, Susanne; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Bioresource technology - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science - 314(2020), Artikel-Nummer 123679, 1 Online-Ressource
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A dynamic model linking cell growth to intracellular metabolism and extracellular byproduct accumulation
Ramos, João R.; Rath, Alexander G.; Genzel, Yvonne; Sandig, Volker; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley . - 2020, insges. 21 S.
Virus harvesting in perfusion culture - choosing the right type of hollow fiber membrane
Nikolay, Alexander; Grooth, Joris; Genzel, Yvonne; Wood, Jeffery A.; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, 2020, insgesamt 13 Seiten[Online first]
Application of an nnclined settler for cell culture-based influenza A virus production in perfusion mode
Coronel, Juliana; Gränicher, Gwendal; Sandig, Volker; Noll, Thomas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, Volume 8 (2020), article 672, insgesmat 13 Seiten
Performance of an acoustic settler versus a hollow fiberbased ATF technology for influenza virus production in perfusion
Gränicher, Gwendal; Coronel, Juliana; Trampler, Felix; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 104.2020, S. 4877-4888
Single-cell analysis uncovers a vast diversity in intracellular viral defective interfering RNA content affecting the large cell-to-cell heterogeneity in influenza A virus replication
Kupke, Sascha Young; Ly, Lam-Ha; Börno, Stefan Thomas; Ruff, Alexander; Timmermann, Bernd; Vingron, Martin; Haas, Stefan; Reichl, Udo
In: Viruses - Basel: MDPI, 12 (2020,1), Artikelnummer 71, 19 Seiten
Production of Modified Vaccinia Ankara virus by intensified cell cultures - a comparison of platform technologies for viral vector production
Gränicher, Gwendal; Tapia, Felipe; Behrendt, Ilona; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Biotechnology journal - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 16 (2021), 1, insges. 10 S., 2020
Dissertation
Intensified yellow fever and Zika virus production in animal cell culture
Nikolay, Alexander; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2020, XV, 175 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 139-157][Literaturverzeichnis: Seite 139-157]
Single-cell analysis of influenza A virus replication - sources of cell-to-cell heterogeneity and discoverey of a novel type of defective interfering particle
Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2020, XV, 155 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 122-136][Literaturverzeichnis: Seite 122-136]
In-depth mass spectrometry-based glycoproteomics - advances in sample preparation, measurement and data-analysis of glycoproteins
Hoffmann, Marcus; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2020, XI, 141 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 118-133][Literaturverzeichnis: Seite 118-133]
Evaluation of MDCK suspension cell lines for influenza A virus production - media, metabolism, and process conditions
Bissinger, Thomas; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2020, XXVI, 137 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 109-125][Literaturverzeichnis: Seite 109-125]
2019
Abstract
Dialyseinduzierte Veränderungen im menschlichen Serum-Protein N-Glykosylation
Lindquist, Jonathan; Hennig, René; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Mertens, Peter Rene
In: Kongress für Nephrologie, 11. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Nephrologie: Die Nephrologie als ganzheitliche Disziplin in der Patientenversorgung : 10. 13. Oktober 2019 in Düsseldorf : Programm/ Kongress für Nephrologie, 2019, P256, S. 165
Aufsatz
Metaproteome analysis reveals that syntrophy, competition, and phage-host interaction shape microbial communities in biogas plants
Heyer, Robert; Schallert, Kay; Siewert, C.; Kohrs, F.; Greve, J.; Maus, I.; Klang, J.; Klocke, M.; Heiermann, M.; Hoffmann, Michael; Püttker, Sebastian; Calusinska, M.; Zoun, Roman; Saake, Gunter; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo
In: Microbiome - London : Biomed Central, Bd. 7 (2019), Artikel 69, insges. 17 S.
RedCom - a strategy for reduced metabolic modeling of complex microbial communities and its application for analyzing experimental datasets from anaerobic digestion
Koch, Sabine; Kohrs, Fabian; Lahmann, Patrick; Bissinger, Thomas; Wendschuh, Stefan; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo
In: PLoS Computational Biology / Public Library of Science - San Francisco, Calif. : Public Library of Science - Vol. 15 (2019), 2, Artikel e1006759, insgesamt 32 Seiten
Buchbeitrag
Metaproteomics of fecal samples of Crohn's disease and Ulcerative Colitis
Lehmann, Tony; Schallert, Kay; Vilchez-Vargas, Ramiro; Benndorf, Dirk; Püttker, Sebastian; Sydor, Svenja; Schulz, Christian; Bechmann, Lars Peter; Canbay, Ali E.; Heidrich, Benjamin; Reichl, Udo; Link, Alexander; Heyer, Robert
In: Journal of proteomics - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 201 (2019), S. 93-103
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Efficient influenza A virus production in high cell density using the novel porcine suspension cell line PBG.PK2.1
Gränicher, Gwendal; Coronel, Juliana; Pralow, Alexander; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Wolff, Michael; Rapp, Erdmann; Karlas, Alexander; Sandig, Volker; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 37.2019, 47, S. 7019-7028
A system for production of defective interfering particles in the absence of infectious influenza A virus
Bdeir, Najat; Arora, Prerna; Gärtner, Sabine; Hoffmann, Markus; Reichl, Udo; Pöhlmann, Stefan; Winkler, Michael
In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, Vol. 14.2019, 3, Artikel e0212757, insgesamt 18 Seiten
High titer MVA and influenza A virus production using a hybrid fed-batch/perfusion strategy with an ATF system
Vázquez Ramírez, Daniel; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 103 (2019), 7, S. 3025-3035
Production of Defective Interfering Particles of influenza A virus in parallel continuous cultures at two residence times - insights from qPCR measurements and viral dynamics modeling
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Laske, Tanja; Wasik, Milena A.; Rammhold, Markus; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, 2013, Volume 7 (2019), Artikel 275, insgesamt 15 Seiten
Hydrophobic-interaction chromatography for purification of influenza A and B virus
Weigel, Thomas; Soliman, Remon; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Journal of chromatography / B - New York, NY [u.a.]: Science Direct, Bd. 1117.2019, S. 103-117
A novel type of influenza a virus-derived defective interfering particle with nucleotide substitutions in its genome
Kupke, Sascha Young; Riedel, Dietmar; Frensing, Timo; Zmora, Pawel; Reichl, Udo
In: Journal of virology: publ. by the American Society for Microbiology - Baltimore, Md.: Soc., 1967, Bd. 93.2019, 4, Art.-Nr. e01786, insges. 24 Seiten
Use of sulfated cellulose membrane adsorbers for chromatographic purification of cell cultured-derived influenza A and B viruses
Fortuna, A. Raquel; van Teeffelen, Sebastian; Ley, Adrian; Fischer, Laura M.; Taft, Florian; Genzel, Yvonne; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Separation and purification technology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1997, Bd. 226.2019, S. 350-358
Continuous influenza virus production in a tubular bioreactor system provides stable titers and avoids the von Magnus effect
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Wohlfahrth, Daniel; Sandig, Volker; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, 2006, 14 (2019), 11, article e0224317, insgesamt 21 Seiten
Enzymatic cascade synthesis provides novel linear human milk oligosaccharides as reference standards for xCGELIF based highthroughput analysis
Fischöder, Thomas; Cajic, Samanta; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Elling, Lothar
In: Biotechnology journal - Weinheim: Wiley-VCH, Vol. 14 (2019), 3, Artikelnr. 1800305, insges. 9 Seiten
Enzymatic cascades for tailored 13 C 6 and 15 N enriched human milk oligosaccharides
Fischöder, Thomas; Cajic, Samanta; Grote, Valerian; Greifenstein, Raphael; Reichl, Udo; Franzreb, Matthias; Rapp, Erdmann; Elling, Lothar
In: Molecules - Basel : MDPI - Volume 24 (2019), 19, Artikel 3482, insgesamt 21 Seiten
A robust and universal metaproteomics workflow for research studies and routine diagnostics within 24 h using phenol extraction, FASP digest, and the MetaProteomeAnalyzer
Heyer, Robert; Schallert, Kay; Büdel, Anja; Zoun, Roman; Dorl, Sebastian; Behne, Alexander; Kohrs, Fabian; Püttker, Sebastian; Siewert, Corina; Muth, Thilo; Saake, Gunter; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Frontiers in microbiology - Lausanne : Frontiers Media - 10 (2019), article 1883, insgesamt 20 Seiten
High-throughput serum N-glycomics - method comparison and application to study rheumatoid arthritis and pregnancy-associated changes
Reiding, Karli R.; Bondt, Albert; Hennig, René; Gardner, Richard A.; O'Flaherty, Roisin; Trbojevič-Akmačič, Irena; Shubhakar, Archana; Hazes, Johanna M. W.; Reichl, Udo; Fernandes, Daryl L.; Pučič-Bakovič, Maja; Rapp, Erdmann; Spencer, Daniel I. R.; Dolhain, Radboud J. E. M.; Rudd, Pauline M.; Lauc, Gordon; Wuhrer, Manfred
In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 18.2019, 1, S. 3-15
Influenza A virus production in a single-use orbital shaken bioreactor with ATF or TFF perfusion systems
Coronel, Juliana; Behrendt, Ilona; Bürgin, Tim; Anderlei, Tibor; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 37.2019, 47, S. 7011-7018
Semi-perfusion cultures of suspension MDCK cells enable high cell concentrations and efficient influenza A virus productionPK2.1
Bissinger, Thomas; Fritsch, Johannes; Mihut, Adrian; Wu, Yxiao; Liu, Xuping; Genzel, Yvonne; Tan, Wen-Song; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 37 (2019), 47, S. 7003-7010
Dissertation
Herstellungsprozess für onkolytische Masernviren
Grein, Tanja A.; Reichl, Udo
In: Düren: Shaker Verlag, 2019, XII, 195 Seiten, 24 Illustrationen, Diagramme, 21 cm, 314 g - (Schriftenreihe des Institutes für Bioverfahrenstechnik und Pharmazeutische Technologie; Band 15)
Charakterisierung der Influenzavirus-Vermehrung in genetisch veränderten humanen Zelllinien zur Optimierung der Impfstoffproduktion
Bachmann, Mandy; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2019, XI, 173 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 133-155][Literaturverzeichnis: Seite 133-155]
Chromatographic purification of biological macromolecules by their capture on hydrophilic surfaces with the aid of non-ionic polymers
Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2019, xiii, 118 Blätter [Literaturverzeichnis: Blatt 99-113][Literaturverzeichnis: Blatt 99-113]
Continuous upstream processing for cell culture-derived virus production
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2019, xv, 112 Blätter [Literaturverzeichnis: Blatt 92-106][Literaturverzeichnis: Blatt 92-106]
2018
Buchbeitrag
Mathematical modeling as a tool to improve influenza vaccine production processes
Duvigneau, Stefanie; Dürr, Robert; Laske, Tanja; Bachmann, Mandy; Dostert, Melanie; Reichl, Udo; Kienle, Achim
In: IFAC-PapersOnLine / Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt : Elsevier, Bd. 51 (2018), Heft 19, S. 1-4
Begutachteter Zeitschriftenartikel
glyXtoolMS - an open-source pipeline for semiautomated analysis of glycopeptide mass spectrometry data
Pioch, Markus; Hoffmann, Marcus; Prahlow, Alexander; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Analytical chemistry: the authoritative voice of the analytical community - Columbus, Ohio: American Chemical Society, 1947, Bd. 90.2018, 20, S. 11908-11916
Cell culture-based production of defective interfering particles for influenza antiviral therapy
Wasik, Milena A.; Eichwald, Luca; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 102.2018, 3, S. 1167-1177, 2017
High-cell-density cultivations to increase MVA virus production
Vázquez Ramírez, Daniel; Genzel, Yvonne; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 36 (2018), 22, S. 3124-3133
Improvement of electrospray stability in negative ion mode for nano-PGC-LC-MS glycoanalysis via post-column make-up flow
Nguyen-Khuong, Terry; Pralow, Alexander; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Glycoconjugate journal: official journal of the International Glycoconjugate Organization - Dordrecht [u.a.]: Springer Science + Business Media B.V, Bd. 35.2018, 6, S. 499-509
MPA portable - a stand-alone software package for analyzing metaproteome samples on the go
Muth, Thilo; Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Martens, Lennart; Renard, Bernhard Y.
In: Analytical chemistry - Columbus, Ohio : American Chemical Society , 1947, Bd. 90 (2018), Heft 1, S. 685-689
Propagation of Brazilian Zika virus strains in static and suspension cultures using Vero and BHK cells
Nikolay, Alexander; Castilho, Leda R.; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 36.2018, 22, S. 3140-3145
Purification of influenza viruslike particles using sulfated cellulose membrane adsorbers
Carvalho, Sofia B.; Fortuna, A. Raquel; Wolff, Michael W.; Peixoto, Cristina; Alves, Paula M.; Reichl, Udo
In: Journal of chemical technology & biotechnology - Chichester: Wiley, Bd. 93.2018, 7, S. 1988-1996[Special issue: Bioseparations]
Establishment of a five-enzyme cell-free cascade for the synthesis of uridine diphosphate N-acetylglucosamine
Mahour, Reza; Klapproth, Jan; Rexer, Thomas F. T.; Schildbach, Anna; Klamt, Steffen; Pietzsch, Markus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 283.2018, S. 120-129
SDSPAGE fractionation to increase metaproteomic insight into the taxonomic and functional composition of microbial communities for biogas plant samples
Wenzel, Lisa; Heyer, Robert; Schallert, Kay; Löser, Lucy; Wünschiers, Röbbe; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 18 (2018), Heft 7, S. 498-509
A multiscale model of influenza A virus replication covering highly different infection conditions in cell cultures
Rüdiger, D.; Kupke, S. Y.; Reichl, Udo
In: IFAC-PapersOnLine/ Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt: Elsevier, Bd. 51.2018, 19, S. 32-33[Konferenz: 7th Conference on Foundation of Systems Biology in Engineering, FOSBE 2018, Chicago, Illinois, USA, 05-08 August 2018]
Valorisation of deinking sludge as a substrate for lignocellulolytic enzymes production by Pleurotus ostreatus
Vodovnik, Maša; Vrabec, Katja; Hellwig, Patrick; Benndorf, Dirk; Sežun, Mija; Gregori, Andrej; Gottumukkala, Lalitha D.; Anderson, Robin C.; Reichl, Udo
In: Journal of cleaner production - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science - Vol. 197.2018, Part 1, S. 253-263
Purification of cell culture-derived influenza A virus via continuous anion exchange chromatography on monoliths
Fischer, Laura M.; Wolff, Michael; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 36.2018, 22, S. 3153-3160
The fine art of destruction - a guide to indepth glycoproteomic analyses-exploiting the diagnostic potential of fragment ions
Hoffmann, Marcus; Pioch, Markus; Pralow, Alexander; Henning, René; Kottler, Robert; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Proteomics - Weinheim: Wiley VCH, 2001, Vol. 18.2018, 24, Art.-Nr. 1800282
Optimization of cell culture-derived influenza A virus particles purification using sulfated cellulose membrane adsorbers
Fortuna, Ana Raquel; Taft, Florian; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Engineering in life sciences - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 18.2018, 1, S. 29-39
Process intensification of EB66® cell cultivations leads to high-yield yellow fever and Zika virus production
Nikolay, Alexander; Léon, Arnaud; Schwamborn, Klaus; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 102.2018, 20, S. 8725-8737
2017
Buchbeitrag
Animal cell expression systems
Butler, M.; Reichl, Udo
In: Advances in biochemical engineering, biotechnology - Berlin: Springer, S. 1-36, 2017[Online first]
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Proteotyping of laboratory-scale biogas plants reveals multiple steady-states in community composition
Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Bissinger, Thomas; Kottler, Robert; Schallert, Kay; Püttker, Sebastian; Behne, Alexander; Rapp, Erdmann; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo
In: Anaerobe - London : Academic Press , 1995, Bd. 46 (2017), S. 56-68
Improvement of the glycoproteomic toolbox with the discovery of a unique C-terminal cleavage specificity of flavastacin for N-glycosylated asparagine
Pralow, Alexander; Hoffmann, Marcus; Nguyen-Khuong, Terry; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature - Bd. 7.2017, Art.-Nr. 11419, insgesamt 9 Seiten
Efficient and stable production of Modified Vaccinia Ankara virus in two-stage semi-continuous and in continuous stirred tank cultivation systems
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: PLOS ONE - San Francisco, California, US : PLOS - Bd. 12.2017, 8, Art.-Nr. e0182553, insges. 17 Seiten
One pot synthesis of GDP-mannose by a multi-enzyme cascade for enzymatic assembly of lipid-linked oligosaccharides
Rexer, Thomas F. T.; Schildbach, Anna; Klapproth, Jan; Schierhorn, Angelika; Mahour, Reza; Pietzsch, Markus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, Bd. 115 (2018), 1, S. 192-205
Steric exclusion chromatography for purification of cell culture-derived influenza A virus using regenerated cellulose membranes and polyethylene glycol
Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Pieler, Michael M.; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Journal of chromatography - New York, NY [u.a.] : Science Direct, Bd. 1483.2017, S. 110-119
Influence of the production system on the surface properties of influenza A virus particles
Hämmerlein, Frank; Pieler, Michael M.; Hennig, René; Serve, Anja; Rapp, Erdmann; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Hubbuch, Jürgen
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 17.2017, 10, S. 1071-1077
Specific ion effects on the particle size distributions of cell culturederived influenza A virus particles within the Hofmeister series
Pieler, Michael Martin; Heyse, Anja; Wolff, Michael Werner; Reichl, Udo
In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 17.2017, 5, S. 470-478
Dissertation
Charakterisierung von mikrobiellen Gemeinschaften aus Biogasanlagen mittels Metaproteomanalyse und Korrelationen der Ergebnisse zu den Prozessparametern
Heyer, Robert Steven; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2017, XVII, 164, xxxvii Blätter, Illustrationen
Investigation of influenza virus particle aggregation and purification with magnetic sulfated cellulose particles
Pieler, Michael Martin; Reichl, Udo
In: Magdeburg, 2017, xxv, 97 Seiten, Illustrationen
Characterisation of cell growth, metabolism and recombinant protein production during transient and steady state conditions for the human cell line AGE1.HN.AAT
Rath, Alexander; Sundmacher, Kai; Reichl, Udo
In: Magdeburg, 2017, XV, 178, xvi Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm
2016
Aufsatz
Predicting compositions of microbial communities from stoichiometric models with applications for the biogas process
Koch, Sabine; Benndorf, Dirk; Fronk, Karen; Reichl, Udo; Klamt, Steffen
In: Biotechnology for biofuels - London : BioMed Central, Bd. 9 (2016), Heft 17, insges. 16 S.
Proteotyping of biogas plant microbiomes separates biogas plants according to process temperature and reactor type
Heyer, Robert; Benndorf, Dirk; Kohrs, F.; Vrieze, J.; Boon, N.; Hoffmann, M.; Rapp, Erdmann; Schlüter, A.; Sczyrba, A.; Reichl, Udo
In: Biotechnology for biofuels - London : BioMed Central, Bd. 9 (2016), Heft 1
Begutachteter Zeitschriftenartikel
A cell culture-derived whole virus influenza A vaccine based on magnetic sulfated cellulose particles confers protection in mice against lethal influenza A virus infection
Pieler, Michael M.; Frentzel, Sarah; Bruder, Dunja; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 34.2016, 50, S. 6367-6374
Impaired antiviral response of adenovirus-transformed cell lines supports virus replication
Bachmann, Mandy; Breitwieser, Theresa; Lipps, Christoph; Wirth, Dagmar; Jordan, Ingo; Reichl, Udo; Frensing, Timo
In: Journal of general virology: JGV - Reading: Soc., 1967, Bd. 97.2016, 2, S. 293-298
Binding kinetics and multi-bond : finding correlations by synthesizing interactions between ligand-coated bionanoparticles and receptor surfaces
Wang, Wenjing; Voigt, Andreas; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai
In: Analytical biochemistry : methods in the biological sciences. - San Diego, Calif : Elsevier, Bd. 505.2016, S. 8-17
Reprint of "Modeling the intracellular replication of influenza A virus in the presence of defective interfering RNAs
Laske, Tanja; Heldt, Frank Stefan; Hoffmann, Helene; Frensing, Timo; Reichl, Udo
In: Virus research : an international journal of molecular and cellular virology. - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science, Bd. 218.2016, S. 86-95
A membrane-based purification process for cell culture-derived influenza A virus
Weigel, Thomas; Solomaier, Thomas; Wehmeyer, Sebastian; Peuker, Alessa; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 220.2016, S. 12-20
Early changes in the metabolic profile of activated CD8+ T cells
Cammann, Clemens; Rath, Alexander; Reichl, Udo; Lingel, Holger; Brunner-Weinzierl, Monika; Simeoni, Luca; Schraven, Burkhart; Lindquist, Jonathan A.
In: BMC cell biology - London : BioMed Central - Bd. 17.2016, Art.-Nr. 28, insges. 11 S.
Towards personalized diagnostics via longitudinal study of the human plasma N-glycome
Hennig, René; Cajic, Samanta; Borowiak, Matthias; Hoffmann, Marcus; Kottler, Robert; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann
In: Biochimica et biophysica acta / General subjects: BBA - Amsterdam [u.a.]: Elsevier, 1964, Bd. 1860.2016, 8, S. 1728-1738
Sialic acid-specific affinity chromatography for the separation of erythropoietin glycoforms using serotonin as a ligand
Meininger, M.; Stepath, M.; Hennig, R.; Cajic, S.; Rapp, E.; Rotering, H.; Wolff, M. W.; Reichl, Udo
In: Journal of chromatography / B - New York, NY [u.a.]: Science Direct, 1977, Bd. 1012/1013.2016, S. 193-203
Diagnostic concept for dynamically operated biogas production plants
Bensmann, Astrid; Hanke-Rauschenbach, Richard; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Kausmann, Robert; Plöchl, Matthias; Heiermann, Monika; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai
In: Renewable energy - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Vol. 96.2016, Part A, S. 479-489
Glycomic characterization of induced pluripotent stem cells derived from a patient suffering from phosphomannomutase 2 congenital Disorder of glycosylation (PMM2-CDG)
Thiesler, Christina T.; Cajic, Samanta; Hoffmann, Dirk; Thiel, Christian; Diepen, Laura van; Hennig, René; Sgodda, Malte; Weiβmann, Robert; Reichl, Udo; Steinemann, Doris; Diekmann, Ulf; Huber, Nicolas M. B.; Oberbeck, Astrid; Cantz, Tobias; Kuss, Andreas W.; Körner, Christian; Schambach, Axel; Rapp, Erdmann; Büttner, Falk
In: Molecular & cellular proteomics - Bethesda, Md. : The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 15 (2016), Heft 4, S. 1435-1452
Ezrin and HNRNP expression correlate with increased virus release rate and early onset of virus-induced apoptosis of MDCK suspension cells
Kluge, Sabine; Genzel, Yvonne; Laus, Kim; Serve, Anja; Pflugmacher, Antje; Peschel, Britta; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Biotechnology journal : BTJ ; systems & synthetic biology, nanobiotech, medicine. - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 11.2016, 10, S. 1332-1342
Metaproteomics applied to activated sludge for industrial wastewater treatment revealed a dominant methylotrophic metabolism of Hyphomicrobium zavarzinii
Salerno, Carlo; Benndorf, Dirk; Pech, Sabine; Palese, Luigi Leonardo; Reichl, Udo; Pollice, Alfieri
In: Microbial ecology - New York, NY: Springer . - 2016
Site-specific O-glycosylation analysis of human blood plasma proteins
Hoffmann, Marcus; Marx, Kristina; Reichl, Udo; Wuhrer, Manfred; Rapp, Erdmann
In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2002, Bd. 15.2016, 2, S. 624-641
Bioreactors for high cell density and continuous multi-stage cultivations: options for process intensification in cell culture-based viral vaccine production
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Vázquez Ramírez, Daniel; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 100 (2016), 5, S. 2121-2132
Influenza virus intracellular replication dynamics, release kinetics, and particle morphology during propagation in MDCK cells
Frensing, Timo; Kupke, Sascha Young; Bachmann, Mandy; Fritzsche, Susanne; Gallo-Ramirez, Lili E.; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 100.2016, 16, S. 7181-7192
Dissertation
Purification of cell culture-derived influenza virus using simulated moving bed chromatography
Kröber, Tina; Reichl, Udo; Seidel-Morgenstern, Andreas
In: Magdeburg, 2016, XX, 171 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm
Etablierung und Anwendung einer durchflusszytometrischen Methode für die Vitalitätsbestimmung von P. aeruginosa, B. cepacia und S. aureus in Mischkulturen
Rüger, Marc; Reichl, Udo
In: Magdeburg, 2016, XIV, 161, viii Blätter, Illustrationen
Novel computational methods for the analysis and interpretation of MS/MS data in metaproteomics
Muth, Thilo; Weiß, Helmut; Reichl, Udo
In: Magdeburg, 2016, XVI, 197 Seiten, Illustrationen
Proteomanalytik der Adaption tierischer Zelllinien an Suspensionswachstum und optimierte Medien im Kontext der Impfstoffproduktion
Pech, Sabine; Reichl, Udo
In: Magdeburg: Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, 2016, XXIV, 192, lxxvii Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm
Modellbasierte Bestimmung von Interventionsstrategien zur Optimierung der Produktion von Biokraftstoffen in Cyanobakterien
Erdrich, Philipp; Reichl, Udo; Kienle, Achim
In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2016, xx, 158 Seiten [Literaturverzeichnis: Seite 131-158][Literaturverzeichnis: Seite 131-158]
2015
Aufsatz
Comparison of influenza virus particle purification using magnetic sulfated cellulose particles with an established centrifugation method for analytics
Serve, Anja; Pieler, Michael Martin; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Wolff, Michael Werner; Reichl, Udo
In: Analytical chemistry - Columbus, Ohio : American Chemical Society, Bd. 87 (2015), Heft 21, S. 10708-10711
Metaproteomics of activated sludge from a wastewater treatment plant - a pilot study
Püttker, Sebastian; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Heyer, Robert; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3596-3601
Fractionation of biogas plant sludge material improves metaproteomic characterization to investigate metabolic activity of microbial communities
Kohrs, Fabian; Wolter, Sophie; Benndorf, Dirk; Heyer, Robert; Hoffmann, Marcus; Rapp, Erdmann; Bremges, Andreas; Sczyrba, Alexander; Schlüter, Andreas; Reichl, Udo
In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3585-3589
Metaproteomics of complex microbial communities in biogas plants
Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk
In: Microbial biotechnology - Oxford : Wiley-Blackwell, Bd. 8 (2015), Heft 5, S. 749-763
The MetaProteomeAnalyzer - a powerful open-source software suite for metaproteomics data analysis and interpretation
Muth, Thilo; Behne, Alexander; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Hoffmann, Marcus; Lehtevä, Miro; Reichl, Udo; Martens, Lennart; Rapp, Erdmann
In: Journal of proteome research - Washington, DC : ACS Publications, Bd. 14 (2015), Heft 3, S. 1557-1565
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Monitoring changes in proteome during stepwise adaptation of a MDCK cell line from adherence to growth in suspension
Pech, Sabine; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Scharfenberg, Klaus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 33 (2015), 35, S. 4269-4280
Bioreactor concepts for cell culture-based viral vaccine production
Gallo-Ramírez, Lilí Esmeralda; Nikolay, Alexander; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Expert review of vaccines - Abingdon, Oxon: Taylor & Francis, 2002, Bd. 14.2015, 9, S. 1181-1195
Exclusive decoration of simian immunodeficiency virus Env with high-mannose type N-glycans is not compatible with mucosal transmission in rhesus macaques
Karsten, Christina B.; Büttner, Falk; Cajic, Samanta; Nehlmeier, Inga; Neumann, Berit; Klippert, Antonina; Sauermann, Ulrike; Reichl, Udo; Gerardy-Schahn, Rita; Rapp, Erdmann; Stahl-Hennig, Christiane; Pöhlmann, Stefan
In: Journal of virology - Baltimore, Md. : Soc., Bd. 89 (2015), Heft 22, S. 11727-11733
Community shifts in a well-operating agricultural biogas plant - how process variations are handled by the microbiome
Theuerl, Susanne; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Maus, Irena; Wibberg, Daniel; Schlüter, Andres; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Pühler, Alfred; Klocke, Michael
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 99 (2015), 18, S. 7791-7803
Modeling the intracellular replication of influenza A virus in the presence of defective interfering RNAs
Laske, Tanja; Heldt, Frank Stefan; Hoffmann, Helene; Frensing, Timo; Reichl, Udo
In: Virus research: an international journal of molecular and cellular virology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 213.2015, S. 90-99
Single-cell analysis and stochastic modelling unveil large cell-to-cell variability in influenza A virus infection
Heldt, Frank S.; Kupke, Sascha Young; Dorl, Sebastian; Reichl, Udo; Frensing, Timo
In: Nature Communications - [London]: Nature Publishing Group UK, 2010, Vol. 6.2015, Art. 8938, insgesamt 12 S.
Editorial: Can modern vaccine technology pursue the success of traditional vaccine manufacturing?
Grabherr, Reingard; Reichl, Udo
In: Biotechnology journal: BTJ : systems & synthetic biology, nanobiotech, medicine - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 10.2015, 5, S. 657-658
Colonic metaproteomic signatures of active bacteria and the host in obesity
Kolmeder, Carolin A.; Ritari, Jarmo; Verdam, Froukje J.; Muth, Thilo; Keskitalo, Salla; Varjosalo, Markku; Fuentes, Susana; Greve, Jan Willem; Buurman, Wim A.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart; Palva, Airi; Salonen, Anne; Rensen, Sander S.; Vos, Willem M.
In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3544-3552
Navigating through metaproteomics data - a logbook of database searching
Muth, Thilo; Kolmeder, Carolin A.; Salojärvi, Jarkko; Keskitalo, Salla; Varjosalo, Markku; Verdam, Froukje J.; Rensen, Sander S.; Reichl, Udo; Vos, Willem M.; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart
In: Proteomics - Weinheim: Wiley VCH, 2001, Bd. 15.2015, 20, S. 3439-3453
Dissertation
Mathematical models of influenza A virus infection - from intracellular replication to virus growth in cell populations
Heldt, Frank Stefan; Frensing, Timo; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2015, 2014, XX, 190 S., graph. Darst.
Population balance modeling of influenza A virus replication in MDCK cells during vaccine production
Müller, Thomas; Kienle, Achim; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Univ., Fak. für Elektrotechnik und Informationstechnik, Diss., 2015, X, 127 S.
Infection dynamics and virus-induced apoptosis in influenza virus A infected adherent and suspension MDCK cells
Peschel, Britta; Reichl, Udo; Marwan, Wolfgang
In: Aachen: Shaker, Zugl.: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2015, VI, 180 S. - (Forschungsberichte aus dem Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme; 44), ISBN: 978-3-8440-3738-8
2014
Aufsatz
Impact of cultivation conditions on N-glycosylation of influenza virus A hemagglutinin produced in MDCK cell culture
Rödig, Jana; Rapp, Erdmann; Bohne, Jana; Kampe, Michael; Kaffka, Helene; Bock, Andreas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo
In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley, Bd. 110 (2014), Heft 6, S. 1691-1703
Sample prefractionation with liquid isoelectric focusing enables in depth microbial metaproteome analysis of mesophilic and thermophilic biogas plants
Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Magnussen, A.; Benndorf, Dirk; Muth, Thilo; Behne, Alexander; Rapp, Erdmann; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Klocke, Michael; Reichl, Udo
In: Anaerobe - London : Academic Press, Bd. 29 (2014), S. 59-67
Buchbeitrag
Species-specific viability analysis of Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia and Staphylococcus aureus in mixed culture by flow cytometry
Rüger, Marc; Ackermann, Mandy; Reichl, Udo
In: BMC microbiology - London : BioMed Central - Bd. 14.2014, Art. 56, insgesamt 15 S.
Flow cytometric viability assessment of lactic acid bacteria starter cultures produced by fluidized bed drying
Bensch, Gerald; Rüger, Marc; Wassermann, Magdalena; Weinholz, Susann; Reichl, Udo; Cordes, Christiana
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 98 (2014), Heft 11, S. 4897-4909
Begutachteter Zeitschriftenartikel
High cell density cultivations by alternating tangential flow (ATF) perfusion for influenza A virus production using suspension cells
Genzel, Yvonne; Vogel, Thomas; Buck, Johannes; Behrendt, Ilona; Vázquez Ramírez, Daniel; Schiedner, Gudrun; Jordan, Ingo; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 32 (2014), 24, S. 2770-2781
Glycolysis is governed by growth regime and simple enzyme regulation in adherent MDCK cells
Rehberg, Markus; Ritter, Joachim B.; Reichl, Udo
In: PLoS Computational Biology: a new community journal - San Francisco, Calif: Public Library of Science, Vol. 10.2014, 10, Art. e1003885, insgesamt 16 S.
Comparative performance of four methods for high-throughput glycosylation analysis of immunoglobulin G in genetic and epidemiological
Huffman, Jennifer E.; Pučić-Baković, Maja; Klarić, Lucija; Hennig, René; Selman, Maurice H. J.; Vučković, Frano; Novokmet, Mislav; Krištić, Jasminka; Borowiak, Matthias; Muth, Thilo; Polašek, Ozren; Razdorov, Genadij; Gornik, Olga; Plomp, Rosina; Theodoratou, Evropi; Wright, Alan F.; Rudan, Igor; Hayward, Caroline; Campbell, Harry; Deelder, André M.; Reichl, Udo; Aulchenko, Yurii S.; Rapp, Erdmann; Wuhrer, Manfred; Lauc, Gordan
In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 13.2014, S. 1598-1610
A flow-through chromatography process for influenza A and B virus purification
Weigel, Thomas; Solomaier, Thomas; Peuker, Alessa; Pathapati, Trinath; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo
In: Journal of virological methods - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 207.2014, S. 45-53
Biological methanation of hydrogen within biogas plants - a model-based feasibility study
Bensmann, Astrid; Hanke-Rauschenbach, R.; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai
In: Applied energy - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 134 (2014), S. 413-425
Avidity of influenza virus: Model-based identification of adsorption kinetics from surface plasmon resonance experiments
Wang, Wenjing; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai
In: Journal of chromatography / A - New York, NY [u.a.]: Science Direct, Bd. 1326.2014, S. 125-129
The influence of cell growth and enzyme activity changes on intracellular metabolite dynamics in AGE1.HN.AAT cells
Rath, Alexander; Rehberg, Markus; Janke, Robert; Genzel, Yvonne; Scholz, Sebastian; Noll, Thomas; Rose, Thomas; Sandig, Volker; Reichl, Udo
In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 178.2014, S. 43-53
Changes in intracellular metabolite pools during growth of adherent MDCK cells in two different media
Rehberg, M.; Rath, A.; Ritter, J. B.; Genzel, Y.; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 98.2014, 1, S. 385-397
Vaccine production - upstream processing with adherent or suspension cell lines
Genzel, Yvonne; Rödig, Jana; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo
In: Animal Cell Biotechnology , 3rd ed. 2014 - Totowa, NJ : Humana Press , 2014, S. 371-393 - (Methods in Molecular Biology, Methods and Protocols; 1104)
The avian cell line AGE1.CR.pIX characterized by metabolic flux analysis
Lohr, Verena; Hädicke, Oliver; Genzel, Yvonne; Jordan, Ingo; Büntemeyer, Heino; Klamt, Steffen; Reichl, Udo
In: BMC biotechnology - London: BioMed Central, Vol. 14.2014, Art. 72 insgesamt 14 S.
Production of high-titer human influenza A virus with adherent and suspension MDCK cells cultured in a single-use hollow fiber bioreactor
Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Vogel, Thomas; Genzel, Yvonne; Behrendt, Ilona; Hirschel, Mark; Gangemi, J. David; Reichl, Udo
In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 32.2014, 8, S. 1003-1011
Impact of defective interfering particles on virus replication and antiviral host response in cell culture-based influenza vaccine production
Frensing, Timo; Pflugmacher, Antje; Bachmann, Mandy; Peschel, Britta; Reichl, Udo
In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 98.2014, 21, S. 8999-9008
Dissertation
Impact of cultivation conditions on N-glycosylation of influenza A virus hemagglutinin, on quasispecies composition, and on immunogenicity of virus preparations
Rödig, Jana Verena; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2014, XVII, 159, S44 Bl., graph. Darst.
Characterization of the avian designer cells AGE1.CR and AGE1.CR.plX considering growth, metabolism and production of influenza virus and Modified Vaccinia Virus Ankara (MVA)
Lohr, Verena; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2014, IX, 178 S., Ill., graph. Darst., 30 cm
Habilitation
Improving industrial antibody manufacturing processes using animal cell culture technology
Pohlscheidt, Michael; Reichl, Udo
In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Habil.-Schr., 2014, Getr. Zählung, Ill., graph. Darst., 30 cm
Herausgeberschaft
Large-Scale Networks in Engineering and Life Sciences
Benner, Peter; Findeisen, Rolf; Flockerzi, Dietrich; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai
In: Cham: Birkhäuser, 2014, Online-Ressource (XIV, 388 p. 111 illus., 63 illus. in color, online resource) - (Modeling and Simulation in Science, Engineering and Technology; SpringerLink; Bücher; Springer eBook Collection; Mathematics and Statistics), ISBN: 978-3-319-08437-4
2013
Aufsatz
Metaproteome analysis of the microbial communities in agricultural biogas plants
Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Klocke, Michael; Reichl, Udo
In: New biotechnology - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 30 (2013), Heft 6, S. 614-622
Begutachteter Zeitschriftenartikel
Multiscale modeling of influenza A virus infection supports the development of direct-acting antivirals
Heldt, Frank S.; Frensing, Timo; Pflugmacher, Antje; Gröpler, Robin; Peschel, Britta; Reichl, Udo
In: PLoS Computational Biology: a new community journal/ Public Library of Science - San Francisco, Calif.: Public Library of Science, 2005, Bd. 9.2013, 11, Art. e1003372, insges. 13 S.
Identification of growth phases and influencing factors in cultivation of AGE1.HN cells using set-based methods
Borchers, Steffen; Freund, Susann; Rath, Alexander; Streif, Stefan; Reichl, Udo; Findeisen, Rolf
In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, 2006, Vol. 8.2013, 8, Art. e68124, insgesamt 11 S.
Searching for a needle in a stack of needles: challenges in metaproteomics data analysis
Muth, Thilo; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart
In: Molecular BioSystems - Cambridge: Royal Society of Chemistry, Bd. 9 (2013), 4, S. 578-585
Comparison of influenza virus yields and apoptosis-induction in an adherent and a suspension MDCK cell line
Peschel, B.; Frentzel, S.; Laske, T.; Genzel, Y.; Reichl, Udo
In: Vaccine. - Amsterdam : Elsevier, Bd. 31.2013, 48, S. 5693-5699
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1980 - 1987 | Studium Biologie, Diplom, Universität Saarbrücken |
1991 | Promotion am Institut für Systemdynamik der Universität Stuttgart, Abschluss: Doktoringenieur (Dr.-Ing.) |
1991 - 1992 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Biotechnologie, University of British Columbia, Vancouver, Kanada |
1992 - 1993 | Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Biotechnologie, Institut für Systemdynamik und Regelungstechnik, Universität Stuttgart |
1993 | Projektleiter „Mikrocarrier“, Pitman-Moore GmbH, Burgwedel |
1993 - 1996 | Abteilungsleiter Virusproduktion, Pitman-Moore GmbH, Burgwedel |
1996 - 1999 | Stellvertretender Herstellungsleiter, Mallinckrodt Vet GmbH / Essex Animal Health, Burgwedel |
seit 1999 | o. Professor für Bioprozesstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg |
seit 2000 | Wissenschaftliches Mitglied der Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. |
seit 2000 | Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Abteilung System- und signalorientierte Bioprozesstechnik, Magdeburg |
2003 - 2004 | Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg |
2005 - 2006 | Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg |
seit 2005 | Mitglied der Perspektivenkommission der CPTS der Max-Planck-Gesellschaft |
2007 - 2013 | Sprecher der IMPRS ("International Max Planck Research School for Analysis, Design and Optimization in Chemical and Biochemical Process Engineering"), Magdeburg |
2009 - 2010 | Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg |
2011 - 2012 | Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg |
2017 - 2018 | Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg |
2019 - 2020 | Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg |
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- Prozessüberwachung und -regelung