Prof. Reichl

Prof. Dr.-Ing. Udo Reichl

Lehrstuhl Bioprozesstechnik
Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik (FVST)
Universitätsplatz 2, 39106 Magdeburg, G25-112
Projekte

Abgeschlossene Projekte

de.NBI-Partner: MetaProteomanalyzer Service
Laufzeit: 01.11.2016 bis 31.12.2021

Die Metaproteomik zielt auf die Erforschung zellulärer Funktionen komplexer Lebensgemeinschaften und ergänzt die Metagenomik und Metatranscriptomik als häufig eingesetzte Werkzeuge in der mikrobiellen Ökologie. Bioinformatische Werkzeuge, die für die Proteomik von Reinkulturen entwickelt wurden, können nicht zufriedenstellend als Ergebnis benutzt werden. So führen Datenbanksuchen für die Proteinidentifizierung mit Metagenomsequenzen zu einer hohen Zahl redundanten Hits in den Suchergebnissen in Bezug auf Taxonomy und Funktion identifizierter Proteine. Für eine bessere Auswertung von Metaproteomdaten wurde deshalb MetaProteomAnalyzer (MPA) Software entwickelt. Im Rahmen von MetaProtServ soll das benutzerfreundliche Programm mit einer graphischen Oberfläche als Webservice verfügbar gemacht werden, um mehr Wissenschaftler von den Vorteilen der Metaproteomik zu überzeugen. Gezieltes Training von Anwendern und ein individueller Support sollen die Zugänglichkeit dieser Software in der wissenschaftlichen Gemeinschaft erleichtern. Die Funktionalität und die Wartungsfreundlichkeit werden für den zukünftigen Webservice sowie für eine eigenständige Version parallel basierend auf einem gemeinsamen Code und einer gemeinsamen Struktur weiterentwickelt.
Die Projektaktivitäten werden koordiniert von Dr. Dirk Benndorf (https://forschung-sachsen-anhalt.de/pl/benndorf-84560).

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Biokatalysatoren in Bioreaktoren: Monitoring, Regelung und multikriterielle Optimierung von Biogasprozessen
Laufzeit: 01.06.2017 bis 30.04.2021

Hauptziel des Vorhabens ist die Charakterisierung der mikrobiellen Stoffwechselaktivitäten in semi-kontinuierlich betriebenen Biogasreaktoren auf Basis vorrangig auftretender mikrobieller Proteine und Enzyme. Die Ergebnisse dieser Studie sollen zur Entwicklung von Strategien zur Unterstützung der Hydrolyse von nachwachsenden Rohstoffen (multikriterielle Optimierung) mittels der gezielten Zugabe von ergänzenden Enzymen pilzlichen Ursprungs komplementär zum bereits vorhandenen endogenen Hydrolysepotenzial dienen. Im Rahmen von Teilvorhaben II erfolgt die systemanalytische Begleitforschung zu den mikrobiellen Stoffwandlungsprozessen der im Teilvorhaben I stattfindenden Fermentationen. Ziel ist die Ermittlung der Zusammensetzung der mikrobiellen Gemeinschaften auf taxonomischer und funktioneller Ebene, das Monitoring von Veränderungen in der Struktur der mikrobiellen Gemeinschaften während der durchgeführten Fermentationen und der jeweiligen prozesstechnischen Variation sowie die Ermittlung von Veränderungen in der metabolischen Aktivität der mikrobiellen Gemeinschaft. Hierzu soll ein kombinierter Ansatz bestehend aus der kontinuierlichen Erfassung der mikrobiellen Populationsdynamik mittels DNA-basierten TRFLP-Fingerprints und punktuell erfolgender Charakterisierung der Zusammensetzung der mikrobiellen Lebensgemeinschaft und deren metabolischem Potential mittels hochauflösenden und kombinierten OMICS-Technologien angewandt werden. Durch den bioinformatischen Abgleich aller erhaltenen Datensätze soll ein funktionelles Netzwerk der Systemmikrobiologie erstellt werden.

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Biogas-Messprogramm III - Teil 2: Systemmikrobiologie; Teilvorhaben 3: Enzymatische Biodiversität
Laufzeit: 01.12.2015 bis 30.11.2019

In Biogasanlagen bewirkt eine komplexe und dynamische mikrobielle Lebensgemeinschaft den anaeroben Aufschluss und Abbau der organischen Biomasse zu energiereichem, methanhaltigem Biogas. Der Großteil der beteiligten Mikroorganismen ist bislang jedoch noch unbekannt, ebenso ihr Einfluss auf die Abbaueffizienz und die Reaktorleistung.
Die in Deutschland betriebenen Biomasse-Biogasanlagen wurden bereits im Rahmen der Biogas-Messprogramme I und II systematisch hinsichtlich Leistung, Funktion, Betriebszuverlässigkeit und Wirtschaftlichkeit untersucht. Jedoch fehlt bislang eine ebenso systematische Erfassung der in Praxis-Biogasanlagen beheimateten Mikroflora.
Im Rahmen des Biogas-Messprogramms III soll daher ein Fokus der Arbeiten auf die Systemmikrobiologie der Biogasanlagen in Deutschland gelegt werden. Ziel ist die Aufklärung des Einflusses abiotischer Prozessparameter auf die mikrobiellen Lebensgemeinschaften in einem Biogasreaktor und deren Stoffwandlungseigenschaften.
Die Projektaktivitäten werden koordiniert von Dr. Dirk Benndorf (https://forschung-sachsen-anhalt.de/pl/benndorf-84560).

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e:Bio - Modul II - Verbundprojekt: CellSys - Systembiologischer Ansatz zur Entwicklung einer Produktionszelllinie für Influenzavakzine - Teilprojekt A
Laufzeit: 01.01.2013 bis 31.08.2016

Das Ziel des Verbundprojekts CellSys ist die Optimierung eines zellkulturbasierten Prozesses zur Herstellung von Influenzaimpfstoffen mit Hilfe eines systembiologischen Ansatzes. Dabei sollen Ergebnisse aus der Grundlagenforschung genutzt werden, um die Virusvermehrung in einer humanen Designerzelllinie durch gentechnische Eingriffe gezielt zu steigern und so eine Hochleistungs-Produktionsplattform für Grippeimpfstoffe zu entwickeln.

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Prozesskontrolle und Optimierung der Biogasproduktion mittels Metaproteomanalyse
Laufzeit: 01.08.2011 bis 30.07.2014

Die Biogasproduktion in Biogasanlagen ist die viertwichtigste Form der Erzeugung von erneuerbaren Energien in Deutschland. Bei diesem Prozess wandelt eine komplexe mikrobielle Gemeinschaft unter anaeroben Bedingungen Biomasse in Methan um. Das Methan wird anschließend in Blockheizkraftwerken zur Bereitstellung von Strom und Wärme genutzt. Für die effiziente Biogasproduktion sind stabile Wachstumsbedingungen für die mikrobiellen Lebensgemeinschaften in den Biogasanlagen wichtig. Beispielsweise führt eine zu schnelle Freisetzung von organischen Säuren aus dem Substrat zu einem starken Abfall des pH-Wertes und damit zum Absterben der methanogenen Mikroorganismen. Ziel dieses Promotionsvorhabens ist die Entwicklung eines auf Markerproteinen basierenden Schnelltestes, um diese Prozessprobleme rechtzeitig zu erkennen und ihnen entgegenwirken zu können. Zur Suche nach diesen Biomarkern sollen die mikrobiellen Lebensgemeinschaften auf dem Niveau der Proteine mittels Metaproteomeanalyse untersucht werden. Erwartet wird ein neuartiger Einblick in die Black Box der Biogasbildung, zum Beispiel durch die Detektion von Proteinen, die spezifisch für die Hydrolyse der Substrate und die Methanogenese sind. Einige dieser Proteine sollen anschließend als Biomarker für einen semiquantitativen Schnelltest auf immunologischer Basis genutzt werden. Dieser Schnelltest soll vor Ort eingesetzt werden und dem Anlagenbetreiber ermöglichen Prozessinstabilitäten frühzeitig zu erkennen. Dadurch können entsprechende Gegenmaßnahmen rechtzeitig ergriffen und so die Leistung und die Ausbeute der Biogasanlage verbessert werden.

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Prozessmikrobiologie in landwirtschaftlichen Biogasanlagen Ermittlung der mikrobiellen Diversität in Biogasanlagen sowie von hauptsächlichen verfahrenstechnischen Einflussfaktoren auf die Mikroflora (BIOGAS-BIOCOENOSIS)
Laufzeit: 01.11.2011 bis 31.10.2013

In Biogasanlagen bewirkt eine komplexe und dynamische mikrobielle Lebensgemeinschaft den Aufschluss und Abbau der organischen Biomasse zu methanhaltigem Biogas. Der Großteil der beteiligten Mikroorganismen ist bislang jedoch noch unbekannt, ebenso ihr Einfluss auf die Reaktoreffizienz. Parallel zu dem bereits durch die FNR geförderten Forschungsvorhabens BiogasEnzyme (FKZ 22027707) soll ein begleitendes Monitoring der Prozessmikrobiologie in ausgewählten landwirtschaftlichen Biogasanlagen stattfinden. Da die meisten der Biogas-Mikroben mittels konventioneller mikrobiologischer Verfahren nicht zu kultivieren sind, sollen vorrangig molekulargenetische Ansätze zur kulturunabhängigen Erfassung der mikrobiellen Diversität auf Basis der Sequenzierung ausgewählter mikrobieller Gene (16S rRNA Gen, mcrA Gen) angewandt werden. Mittels modernster Hochdurchsatz-Technologien wie der 454-Pyrosequenzierung soll ein umfangreicher Datenbestand erarbeitet werden, welche eine Analyse der Auswirkung verschiedener Betriebsweisen von Biogasanlagen auf die Prozessmikrobiologie erlauben. Weiterhin sollen ebenfalls Zusammenhänge zwischen Prozessmikrobiologie sowie Reaktorleistung ermittelt werden. Es wird erwartet, dass sich aus dem Datenmaterial Aussagen über besonders prozessrelevante Arten oder Organismengruppen ableiten lassen, welche als Grundlage für eine weitere biotechnologische Optimierung der Biogasfermentation genutzt werden können.

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Analyse von Enzymaktivitäten und Durchführung von Gärversuchen
Laufzeit: 01.12.2012 bis 01.03.2013

Das Ziel des Projektes ist die Entwicklung eines konkreten enzymatischen Verfahrens zur Vorbehandlung von Rübenpressschnitzel-Silage. Dabei sollen Pektine entfernt, und damit die Viskosität des Gärsubstrats verringert werden. Grundlagen des Projekts bilden Laborversuche in Form von Messungen der Enzymaktivität und der Beurteilung des Gärverhaltens.

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Kultivierung und Infektion von CAP Zelllinien
Laufzeit: 01.08.2009 bis 15.12.2012

Neu entwickelte humane Suspensionszellen sollen überprüft werden, ob sie als Substrat zur Influenzavirus-Vermehrung dienen können. Dabei soll abgeschätzt werden, ob ein Impfstoff Herstellungsprozess analog zu bestehenden Zellkultur-Prozessen möglich wäre. Dazu wird die Vermehrung verschiedener Influenzaviren unter unterschiedlichen Prozessbedingungen bis zu einem Produktionsmaßstab von 1 L im Bioreaktor getestet.

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Einsatz synthetischer Liganden zur Aufreinigung salinsäurehaltiger, rekombinanter humaner Proteine und Impfstoff-Antigene
Laufzeit: 01.10.2008 bis 31.03.2012

Das Projekt hat zum Ziel die Stärkung des Produktionsstandortes in der Biotechnologie sowie die Entwicklung neuer Aufreinigungstechnologien. Unter anderem soll die Entwicklung hochaffiner sialinsäure-spezifischer Liganden zur Aufreinigung rhu-Proteine sowie die Entwicklung hochaffiner kontinuierlicher (SMB) und diskontinuierlicher Trennverfahren für virale Antigene und Influenzaviren und der Ausbau von Ausbildungsmöglichkeiten im Bereich "DSP bilogischer und pharmazeutischer Wirkstoffe" erforscht und verbessert werden.

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Dynamics of Influenza A Virus Replication in Epithelial Cells
Laufzeit: 01.01.2007 bis 31.12.2011

Die in höheren Organismen anzutreffende angeborene Immunität stellt bei viraler Infektion eine erste wichtige Verteidigungslinie dar. Für eine effektive Immunabwehr bedarf es vielfältiger intra- und interzellulärer Signalübertragungsmechanismen. Hierbei können infizierte Zellen den kontrollierten Zelltod, auch Apoptose genannt, auslösen, um eine Virusvermehrung zu verhindern. Diese hochkomplexen Mechanismen sind auch in Zellkulturen vorzufinden, die zur Virusimpfstoffproduktion eingesetzt werden. Daher untersuchen wir am Lehrstuhl Bioprozesstechnik, welche der antiviralen Signalübertragungsmechanismen während der Impfstoffproduktion aktiviert werden. Das bessere Verständnis dieser im Bioprozess auftretenden antiviralen Signalwege und der Apoptose soll es ermöglichen, über molekularbiologische Methoden die Impfstoffausbeute zu steigern.

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Dynamische Systeme in Biologie / Medizin und Prozesstechnik
Laufzeit: 01.06.2008 bis 31.12.2011

Mammalian cells are of increasing importance as host system for virus replication, e.g. in influenza vaccine production. Fundamental virological and cell biological research is focused on qualitative virus-host cell interactions. However, comparatively little is known about the quantitative aspects of virus replication and the correlated host cell response.   In this project, progress of virus infection, extent of influenza virus-induced apoptosis, and impact of cultivation conditions on virus yields are being investigated by flow cytometry in cell cultures. Experimental data sets are used in several collaborations to establish mathematical models describing population dynamics at various levels of complexity.

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FORSYS - Systemanalyse von Signal und Regulationsnetzwerken
Laufzeit: 01.01.2007 bis 31.12.2011

Der interdisziplinäre Studiengang Biosystemtechnik an der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg vermittelt den Studenten Wissen aus den Bereichen Ingenieurwissenschaften, Systemwissenschaften, Biologie und Medizin. Diese Ausbildung im Bereich Systembiologie befähigt Absolventen insbesondere zum Umgang mit großen Mengen an biologischen Daten und ihrer Modellierung und eröffnet ihnen Tätigkeitsfelder in Forschung und Industrie.

Im Rahmen der Umstellung des Studienganges von Diplom auf Bachelor und Master soll die Qualität der Ausbildung durch das Angebot veränderter und neuer Lehrveranstaltungen erhöht werden. Das Projekt unterstützt besonders die Durchführung von Laborpraktika in den biologischen Fächern durch die Bereitstellung von Investitionsmitteln für die Ausstattung der Kursräume sowie durch die Finanzierung von Personal zur Durchführung der Kurse (zum Beispiel Mikrobiologie und Cell Culture Engineerring).

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Purification and Characterization of Vaccinia virus with special emphasis on MVA-BN®
Laufzeit: 01.03.2007 bis 30.09.2009

Development of an affinity chromatography purification of cell culture derived Vaccinia Virus (VV) after an initial host cell homogenization and clearance centrifugation. The affinity chromatography is based on the interaction between the VV surface protein A27L and heparin, which is currently further characterized by surface plasmon resonance technology. In addition, heparin like molecules are investigated. Moreover, classical ion exchange membrane chromatography and cellufine sulfate with heparin derivatized membrane chromatography are characterized including the removal rate of contaminating host cell proteins and DNA.

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Experimentelle Charakterisierung und Dynamik komplexer mikrobieller Gemeinschaften - Wachstumsanalyse einer Modellgemeinschaft mit Relevanz für die klinische Praxis
Laufzeit: 01.10.2005 bis 31.03.2009

Eine medizinisch relevante bakterielle Modellgemeinschaft aus mindestens 3 Spezies soll experimentell untersucht und ihre Wachstumsdynamik mathematisch analysiert werden. Z.B. sollen Konkurrenz oder Kooperation unter den Spezies und wichtige Einflussgrößen des gemeinsamen Wachstums gesucht werden, welche möglicherweise bei Lungeninfektionen eine Rolle spielen. Ein geeignetes mathematisches Modell der Dynamik des heterogenen bakteriellen Systems soll entwickelt werden. Eine eigene molekularbiologische Analysemethode erlaubt die quantitative Überprüfung getroffener Modellannahmen durch Keimzahlbestimmung gemischter Proben. Die quantitative Verifizierung eines Chemostatmodells für 3 Spezies ist unseres Wissens in der Literatur nicht beschrieben und stellt einen hohen Neuigkeitswert dar. Der Einfluss ausgewählter Parameter oder Störgrößen wie z.B. Antibiotika oder Substratwechsel auf die Mischkultur soll in einem computergesteuertem Bioreaktor untersucht werden. Primärziel ist die Etablierung einer reproduzierbaren Mischkultur in einem Gleichgewichtszustand für die weitere Systemanalyse.

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Untersuchung des Einflusses von Genregulatorelementen auf die segregationale Plasmidstabilität und Modellierung von rekombinanten Fermentationsprozessen
Laufzeit: 01.01.2006 bis 31.12.2007

    • Konstruktion von Plasmiden, die das Human- Interferon gamma-Gen exprimieren und unterschiedlich modifizierte Genregulatorelemente enthalten. Die Plasmide sollen sich durch eine unterschiedliche Transkriptions- und Translationseffektivität des heterologen Gens auszeichnen.
    • Durchführung von Batch- und kontinuerlichen Fermentationen zur Ermittlung des Einflusses der Transkriptions- und Translationseffektivität des Human-Interferon gamma - Gens auf die segregationale Stabilität der untersuchten Plasmide.
    • Modellierung und Analyse des Fermentationsprozesses zur Produktion von rekombinantem Human-Interferon gamma mit E.coli. Das Modellieren des Fermentationsprozesses sollte eine Grundvoraussetzung für seine Optimierung sein.
    • Konstruktion von Expressionsvektoren, die einen erhöhten Ertrag an Human-Interferon gamma im Bioreaktor gewährleisten sollen und sich durch eine hohe segregationale Stabilität auszeichnen.

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Charakterisierung eines automatischen, sterilen, totvolumenfreien Probenahme-Moduls für Bioreaktoren
Laufzeit: 01.05.2005 bis 31.01.2006

Probenahme-Sonden sind Teile von manuellen oder automatischen Vorrichtungen zur Probenahme, ohne die Abläufe in Reaktoren nicht umfassend untersucht werden können. In der Fachgruppe Bioprozesstechnik (BPT) am MPI Magdeburg wurde eine Probenahme-Sonde entwickelt und patentiert (WO 2004/033077 A3). Diese erweist sich aus funktionellen und ökonomischen Gründen, wie einfacher Aufbau, Validierbarkeit, unkomplizierte Gestaltung von automatischen Verfahren der Probenahme, als geeignet für die Ausrüstung von Fermentern. Um die Sonde in Fermentersysteme einzugliedern, ist eine eingehende Untersuchung und die Bestimmung von Parametern, wie z.B. Sterilisierbarkeit, Druckstabilität, Förderraten usw. notwendig, die für eine Anwendung als Serienbauteil ausschlaggebend sind. Das Ziel der Arbeit ist ein leistungsfähiges und anwenderfreundliches Produkt.

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Plasmidstabilität update
Laufzeit: 01.02.2005 bis 31.12.2005

1. Konstruktion von Plasmiden, die das Human- Interferon gamma Gen exprimieren und unterschiedlich modifizierte Genregulatorelemente enthalten. Die Plasmide sollen sich durch eine unterschiedliche Transkriptions- und Translationseffektivität des heterologen Gens auszeichnen. 2. Durchführung von Batch- und kontinuerlichen Fermentationen zur Ermittlung des Einflusses der Transkriptions- und Translationseffektivität des Human-Interferon gamma Gens auf die segregationale Stabilität der untersuchten Plasmide. 3. Modellierung und Analyse des Fermentationsprozesses zur Produktion von rekombinantem Human-Interferon gamma mit E.coli. Das Modellieren des Fermentationsprozesses sollte  eine Grundvoraussetzung für seine Optimierung sein. 4. Konstruktion von Expressionsvektoren, die einen erhöhten Ertrag an Human-Interferon gamma im Bioreaktor gewährleisten sollen und sich durch eine hohe segregationale Stabilität auszeichnen.

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Weiterführung der Virusaufreinigung mittels Membranrekuperator
Laufzeit: 01.10.2005 bis 31.12.2005

Aufbauend auf den Ergebnissen einer Studie mit Membranrekuperatoren sollen weiterführende Versuche zur Aufreinigung des Pferde Influenza A NM/1/93 (H3N8) in den Laboratorien des Lehrstuhls Bioprozesstechnik der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg durchgeführt werden. Das Ziel des Projekts ist die weiterführende Machbarkeitsstudie zur Influenzavirusaufreinigung von vorgeklärten Fermentationslösungen mittels Membranrekuperatoren.

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Virusaufreinigung mitels Membranrekuperator
Laufzeit: 01.09.2005 bis 30.11.2005

Die Aufreinigung verschiedener Viren mittels Anionenaustausch-Membranchromatographie (AExMCh) ist mehrfach gezeigt worden und findet kommerziellen Einsatz in Kits. Ergebnisse von Aufreinigungsstudien mit Ionenaustauschermembranen zeigen, dass sich die Membranchromatographie von der herkömmlichen Säulenchromatographie durch höhere Bindungskapazitäten, höhere Wiederfindungsraten und erhöhtem Durchsatz unterscheidet. In der Säulenchromatographie gibt es etablierte Systeme wie z. B. die Expanded Bed Chromatographie (EBA), die auch mit ungeklärten Fermentationslösungen beaufschlagt werden können. Diese werden mit Erfolg, z.B. für die Proteinaufreinigung, eingesetzt.Ziel dieser Arbeit ist der Test von einem neuartigen Membran-Chromatographiesystem (Rekuperator), zur Konzentrierung und begrenzten Aufreinigung von Influenza A PR/8/34 (H1N1) aus geklärten Fermentationsbrühen. Abhängig von den Ergebnissen der Versuchsreihen können in einem Folgeversuch ungeklärte Fermentationsbrühen getestet werden.

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Optimierungsstudie: Charakterisierung und Optimierung der MVA Vermehrung in primären HEF zur Herstellung von Impfstoffen
Laufzeit: 15.06.2004 bis 15.06.2005

Optimierungsstudie: Charakterisierung und Optimierung der Vermehrung von Vaccina Viren in primären Hühnerembryo Fibroblasten (HEF) zur Herstellung von rekombinanten Impfstoffen. Weitere Kurzbeschreibungen fehlen.

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Entwicklung eines Microcarrier-basierten Herstellungsverfahrens für einen Impfstoff gegen Schweine-Influenza
Laufzeit: 01.10.2004 bis 30.05.2005

Ein Verfahren zur Vermehrung von MDBK-Zellen auf Microcarriern (Cytodex1, Cytodex 3, …) im Maßstab von 0.5-1.0 L soll etabliert und die Vermehrung des Schweine-Influenza-Virus auf diesem System optimiert werden. Dem Kulturmedium wird tierisches Serum zugesetzt, um die Anheftung der Zellen und damit die Verfahrensentwicklung zu vereinfachen. Das langfristige Ziel, ggf. in einem Folgeprojekt, ist die Entwicklung eines serumfreien Kultivierungsverfahrens.

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Bioreaktor mit Sensorik
Laufzeit: 01.10.2004 bis 31.12.2004

Anwendungsnahes Forschungsvorhaben im Bereich Zellkulturtechnologie zur Entwicklung und Optimierung von Prozessen zur Herstellung von innovativen Impfstoffen, viralen Vektoren, Antigenen und rekombinanten Proteinen.

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Downstream Processing of Viral Vaccines
Laufzeit: 01.06.2004 bis 30.11.2004

The project focuses on chromatographic methods (size exclusion, anion exchange). Inactivated antigen for parallel investigations using different matrices or operating conditions is produced in roller bottles (1-2 L wv) and microcarrier bioreactors (2.5-4 L wv). Chromatography media will be tested in group separation mode to remove bulk protein from the virus. The objective is to maximize purity, viral yield, throughput and cycle times. Ion exchange chromatography will be operated in negative mode (virus in flow-through). Negatively charged species (mainly nucleic acids) are to be retained by the matrix. The aim is a high reduction in host cell DNA (below detection limit) combined with high recovery of the virus.

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Evaluation of membrane techniques in downstream processing of influenza virus
Laufzeit: 01.08.2004 bis 30.11.2004

Use of cross flow microfiltration to replace current depth filtration and ultrafiltration methods in downstream processing of inactivated vaccines. The purpose of the microfiltration step is the removal of contaminants that can pass through the membrane pores, buffer exchange (e.g. low salt buffer) and concentration of the virus particles. The effect of membrane pore sizes on virus retention and contaminant removal will be determined. A range of operating conditions (feed flow/wall shear rates, transmembrane pressure drops) and their influence on processing time, membrane fouling, recovery, etc. will be investigated. In addition a comparison of ion exchange membranes and resins will be conducted in order to compare the performance of ion exchange membranes and resin for virus purification. The performance of membranes and resins will beevaluated by determining breakthrough curves (dynamic capacities), adsorption isotherms, resolution and viral recovery. The results obtained for ion exchange resins and membranes will be compared to results obtained for downstream processing steps currently in use.

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Entwicklung und Erprobung von Prozessführungskonzepten zur Herstellung von inaktivierten Virusimpfstoffen
Laufzeit: 01.06.2001 bis 31.05.2004

On-line Datenerfassung: Entwicklung einer Probenahmeapparatur, die es ermöglicht, kontinuierlich und totvolumenfrei, Proben aus Bioreaktoren zu entnehmen. Prozessüberwachung: Zur Kontrolle der wichtigsten Stoffwechselmetabolite tierischer Zellen. Mathematische Modellierung: Die Herstellung von Impfstoffen in tierischen Zellen geschieht in der Regel in einem zweistufigen Prozess - auf einen Scale-up zur Zellvermehrung folgt die Infektion mit anschließender Virusvermehrung. Im Rahmen des Projektes wurden zunächst umfangreiche Arbeiten zur quantitativen Analyse des Infektionsvorganges durchgeführt. Es wurde ein grundlegendes mathematisches Modell entwickelt, das es gestattet, die Population von uninfizierten Zellen, infizierten Zellen und freigesetzten Viren quantitativ zu beschreiben und Simulationen zur Analyse derjenigen Parameter, die im wesentlichen die Ausbeute von Impfstoffpozessen bestimmen, durchzuführen.

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Entwicklung eines Verfahrens für die großtechnische Herstellung von rekombinanten MVA als AIDS Vakzine in permanenten Hühnerembryofibroblasten
Laufzeit: 01.04.2003 bis 31.01.2004

Für den Einsatz als AIDS-Impfstoff wurde ein rekombinantes Vaccina Virus (MVA) entwickelt, das sich in der klinischen Prüfung Phase II befindet. Als Kultivationssubstrat für MVA dienen primäre Hühnerembryo Fibroblasten (HEF). In der ersten Phase muss für die permanente HEF zunächst im kleinen Maßstab (Zellkulturflasche z.B. T 25) ein geeignetes Kulturmedium gefunden werden, in dem die Parameter für Wachstum, zusätzlich Stoffwechsel und ggf. Anheftung der Zellen an Microcarrier in einem optimalen Bereich liegen. In geeigneten Medien wird die Virusvermehrung orientierend geprüft. Im weiteren Verlauf werden im 0,5-1L Maßstab (Sixfors-Kleinfermenter, WAVE-Reaktor) Stoffwechsel, Wachstum der Zellen mit und ohne Microcarrier und Virusvermehrung in einem Kulturmedium charakterisiert und verglichen. Das hinsichtlich Zellwachstum und Virusproduktion optimierte Verfahren wird anschließend in einen größeren Maßstab (5L Rührreaktor, WAVE) übertragen.

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Entwicklung eines serumfreien Kultivierungsverfahrens von primären Hühnerembryofibroblasten auf Microcarriern
Laufzeit: 01.02.2002 bis 31.12.2003

Primäre Hühnerembryofibroblasten (HEF) dienen als sicheres und effizientes Kultivationssubstrat zur Herstellung einer Reihe veterinärmedizinischer und humanmedizinischer Impfstoffe.Standardverfahren ist derzeit die Kultivierung in der Rollerflasche. Für eine großtechnische Zellkultivierung sind dabei mit hohem personellen und manuellen Aufwand große Stückzahlen von Rollerflaschen zu bearbeiten. Außerdem werden erhebliche Produktionslaborkapazitäten benötigt und die Handhabung einer Vielzahl von Kultivationsbehältnissen vergrößert das Kontaminationsrisiko.Ziel dieses Projektes ist, ein Verfahren zur Kultivierung von primären HEF auf Microcarriern zu etablieren.Die adhärente Zelllinie soll großtechnisch unter serumfreien Bedingungen in Bioreaktoren oder in WAVE® Systemen vermehrt werden. Anschließend sollen beide Kultursysteme hinsichtlich Virusausbeuten verglichen werden.

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Entwicklung eines Herstellungsverfahrens für einen Impfstoff gegen Nerzenteritis
Laufzeit: 01.09.2002 bis 31.10.2003

Die E-FL Zelle dient als Kultivationssubstrat zur Vermehrung von Mink Enteritis Virus. Standardverfahren ist derzeit die Kultivierung in der Rollerflasche. Für eine großtechnische Zellkultivierung sind dabei mit hohem personellen und manuellen Aufwand große Stückzahlen von Rollerflaschen zu bearbeiten. Außerdem werden erhebliche Produktionslaborkapazitäten benötigt.Weiterhin ist die Vermehrung des Nerz Enteritis Virus biologisch direkt an die Zellvermehrung gebunden und deshalb relativ kompliziert zu optimieren.Ziel dieses Projektes ist, ein Verfahren zur Vermehrung von E-FL Zellen auf Microcarriern zu etablieren und die Virusvermehrung auf diesem System zu optimieren.Die adhärente Zelllinie soll großtechnisch in Fermentoren oder in WAVE® Systemen vermehrt werden. Weiterhin wird in diesen Systemen die Optimierung der Virusvermehrung geprüft.

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Publikationen

2024

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Model-based optimization of cell-free enzyme cascades exemplified for the production of GDP-fucose

Huber, Nicolas; Alcalá-Orozco, Edgar Alberto; Rexer, Thomas; Reichl, Udo; Klamt, Steffen

In: Metabolic engineering - Orlando, Fla. : Academic Press, Bd. 81 (2024), S. 10-25

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Breakdown of hardly degradable carbohydrates (lignocellulose) in a two-stage anaerobic digestion plant is favored in the main fermenter

Heyer, Robert; Hellwig, Patrick; Maus, Irena; Walke, Danile; Schlüter, Andreas; Hassa, Julia; Sczyrba, Alexander; Tubbesing, Tom; Klocke, Michael; Mächtig, Torsten; Schallert, Kay; Seick, Ingolf; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Water research - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science, Bd. 250 (2024), Artikel 121020, insges. 11 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

From single-cell cloning to high-yield influenza virus production - implementing advanced technologies in vaccine process development

Zinnecker, Tilia; Badri, Najd; Araujo, Diogo; Thiele, Kristin; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH . - 2024, insges. 14 S. [Online first]

2023

Buchbeitrag

Upstream processing for viral vaccines - process intensification

Göbel, Sven; Pelz, Lars; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Bioprocessing of viral vaccines , First edition - Abgingdon : Taylor & Francis ; Kamen, Amine . - 2023, S. 137-173

Buchbeitrag

Upstream processing for viral vaccines - general aspects

Pelz, Lars; Göbel, Sven; Jaen, Karim; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Bioprocessing of viral vaccines , First edition - Abgingdon : Taylor & Francis ; Kamen, Amine . - 2023, S. 79-135

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Removable Ddes - the missing link for in-depth N-glycan analysis via multi-method approaches

Cajic, Samanta; Hennig, René; Grote, Valerian; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Engineering - Beijing : Engineering Sciences Press., Bd. 26 (2023), S. 132-150

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell-free N-glycosylation of peptides using synthetic lipid-linked hybrid and complex N-glycans

Wenzel, Lisa; Hoffmann, Marcus; Rapp, Erdmann; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo

In: Frontiers in molecular biosciences - Lausanne : Frontiers, Bd. 10 (2023), insges. 11 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A cell-free multi-enzyme cascade reaction for the synthesis of CDP-glycerol

Alcalá-Orozco, E. Alberto; Grote, Valerian; Fiebig, Timm; Klamt, Steffen; Reichl, Udo; Rexer, Thomas

In: ChemBioChem - Weinheim : Wiley-VCH . - 2023, Artikel e202300463 [Early view]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Characterization of a quail suspension cell line for production of a fusogenic oncolytic virus

Göbel, Sven; Jaén, Karim E.; Fernandes, Rita P.; Reiter, Manfred; Altomonte, Jennifer; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley . - 2023, insges. 12 S. [Early view]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Broad-spectrum antiviral activity of influenza A Defective Interfering Particles against respiratory syncytial, yellow fever, and Zika virus replication in vitro

Pelz, Lars; Piagnani, Elena; Marsall, Patrick; Wynserski, Nancy; Hein, Marc Dominique; Marichal-Gallardo, Pavel; Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo

In: Viruses - Basel : MDPI, Bd. 15 (2023), Heft 9, Artikel 1872, insges. 17 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Production of retroviral vectors in continuous high cell density culture

Hein, Marc D.; Kazenmaier, Daniel; van Heuvel, Yasemin; Dogra, Tanya; Cattaneo, Maurizio; Kupke, Sascha Y.; Stitz, Jörn; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 107 (2023), S. 5947-5961

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell-free biosynthesis meets dynamic optimization and control - a fed-batch framework

Espinel-Ríos, Sebastián; Huber, Nicolas; Alcalá-Orozco, Edgar Alberto; Morabito, Bruno; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo; Klamt, Steffen; Findeisen, Rolf

In: IFAC-PapersOnLine / Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt : Elsevier, Bd. 55 (2022), Heft 23, S. 92-97

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Reliable N-glycan analysis - removal of frequently occurring oligosaccharide impurities by enzymatic degradation

Burock, Robert; Cajic, Samanta; Henning, René; Buettner, Falk, F. R.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Molecules - Basel : MDPI, Bd. 28 (2023), Heft 4, Artikel 1843, insges. 19 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Process intensification strategies toward cell culture-based high-yield production of a fusogenic oncolytic virus

Göbel, Sven; Jaén, Karim E.; Dorn, Marie; Neumeyer, Victoria; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Altomonte, Jennifer; Genzel, Yvonne

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley . - 2023, insges. 19 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Degradation kinetics of lignocellulolytic enzymes in a biogas reactor using quantitative mass spectrometry

Küchler, Jan; Willenbücher, Katharina; Reiß, Elisabeth; Nuß, Lea; Conrady, Marius; Ramm, Patrice; Schimpf, Ulrike; Reichl, Udo; Szewzyk, Ulrich; Benndorf, Dirk

In: Fermentation - Basel : MDPI, Bd. 9 (2023), Heft 1, Artikel 67, 1 Online-Ressource (12 Seiten)

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Generation of "OP7 chimera" defective interfering influenza A particle preparations free of infectious virus that show antiviral efficacy in mice

Dogra, Tanya; Pelz, Lars; Boehme, Julia D.; Kuechler, Jan; Kershaw, Olivia; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Baelkner, Maike; Hein, Marc Dominique; Gruber, Achim; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Bruder, Dunja; Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo

In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature, Bd. 13 (2023), Artikel 20936, insges. 13 S.

2022

Aufsatz

Absolute quantification of viral proteins during single-round replication of MDCK suspension cells

Küchler, Jan; Püttker, Sebastian; Lahmann, Patrick; Genzel, Yvonne; Kupke, Sascha; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo

In: Journal of proteomics - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 259 (2022), Artikel 104544, insges. 10 S.

Aufsatz

Discovering biomarkers for non-alcoholic steatohepatitis patients with and without hepatocellular carcinoma using fecal metaproteomics

Sydor, Svenja; Dandyk, Christian; Schwerdt, Johannes; Manka, Paul; Benndorf, Dirk; Lehmann, Theresa; Schallert, Kay; Wolf, Maximilian; Reichl, Udo; Canbay, Ali E.; Bechmann, Lars P.; Heyer, Robert

In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 23 (2022), Heft 16, Artikel 8841, insges. 14 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High-titer hepatitis C virus production in a scalable single-use high cell density bioreactor

Offersgaard, Anna; Duarte Hernandez, Carlos Rene; Pihl, Anne Finne; Venkatesan, Nadini Prabhakar; Krarup, Henrik; Lin, Xiangliang; Reichl, Udo; Bukh, Jens; Genzel, Yvonnne; Gottwein, Judith Margarete

In: Vaccines - Basel : MDPI, Bd. 10 (2022), Heft 2, Artikel 249, insges. 24 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Adaptation of a microbial community to demand-oriented biological methanation

Khesali Aghtaei, Hoda; Püttker, Sebastian; Maus, Irena; Heyer, Robert; Huang, Liren; Sczyrba, Alexander; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Biotechnology for biofuels and bioproducts - London : BioMed Central , 2022, Bd. 15 (2022), Heft 1, Artikel 125, 1 Online-Ressource (19 Seiten)

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Human 3D airway tissue models for real-time microscopy - visualizing respiratory virus spreading

Möckel, Marion; Baldok, Nino; Walles, Thorsten; Hartig, Roland; Müller, Andreas Johann; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne; Walles, Heike; Wiese-Rischke, Cornelia

In: Cells - Basel : MDPI, Bd. 11 (2022), Heft 22, Artikel 3634, insges. 21 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell-line screening and process development for a fusogenic oncolytic virus in small-scale suspension cultures

Göbel, Sven; Kortum, Fabian; Chavez, Karim Jaén; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Altomonte, Jennifer; Genzel, Yvonne

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 106 (2022), Heft 13/16, S. 4945-4961

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Impact of influenza A virus infection on growth and metabolism of suspension MDCK cells using a dynamic model

Ramos, João Rodrigues Correia; Bissinger, Thomas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Metabolites - Basel : MDPI, Bd. 12 (2022), Heft 3, Artikel 239, insges. 27 S.

Dissertation

Development of chromatography-based purification processes for cell culture-derived influenza virus particles

Weigel, Thomas; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2022, 1 Online-Ressource (XXII, 145 Seiten, 2,22 MB) [Literaturverzeichnis: Seite 119-133]

Dissertation

Cell culture-based production of influenza A virus-derived defective interfering particles

Hein, Marc Dominique; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2022, 1 Online-Ressource (XV, 98, XVII-L Seiten, 5,1 MB) [Literaturverzeichnis: Seite XX-XXXVII]

Dissertation

Mathematical models of influenza A virus infection - multiplicity of infection and its impact on co-infection and virus production

Rüdiger, Daniel; Tsotsas, Evangelos; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2022, 1 Online-Ressource (XVIII, 179 Seiten, 8,16 MB), Illustrationen

2021

Aufsatz

Tracking changes in adaptation to suspension growth for MDCK cells: cell growth correlates with levels of metabolites, enzymes and proteins

Pech, Sabine; Rehberg, Markus; Janke, Robert; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Muth, Thilo; Sickmann, Albert; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer, Bd. 105 (2021), S. 1861-1874

Aufsatz

Fecal metaproteomics reveals reduced gut inflammation and changed microbial metabolism following lifestyle-induced weight loss

Biemann, Ronald; Buß, Enrico; Benndorf, Dirk; Lehmann, Theresa; Schallert, Kay; Püttker, Sebastian; Reichl, Udo; Isermann, Berend; Schneider, Jochen; Saake, Gunter; Heyer, Robert

In: Biomolecules - Basel : MDPI - Vol.11.2021, 5, 726, insgesamt 13 Seiten

Buchbeitrag

Preface

Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Advances in Glycobiotechnology - Cham: Springer International Publishing; Rapp, Erdmann . - 2021, S. v-vi

Buchbeitrag

Correction to: Animal Cell Expression Systems

Butler, M.; Reichl, Udo

In: Advances in Glycobiotechnology - Cham: Springer International Publishing; Rapp, Erdmann . - 2021, S. 459-461

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Towards integrated production of an influenza A vaccine candidate with MDCK suspension cells

Bissinger, Thomas; Wu, Yixiao; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Riedel, Dietmar; Liu, Xuping; Genzel, Yvonne; Tan, Wen-Song; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, Bd. 118 (2021), 10, S. 3996-4013

Begutachteter Zeitschriftenartikel

OP7, a novel influenza A virus defective interfering particle - production, purification, and animal experiments demonstrating antiviral potential

Hein, Marc D.; Kollmus, Heike; Marichal-Gallardo, Pavel; Püttker, Sebastian; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Schughart, Klaus; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin : Springer , 1975, Bd. 105 (2021), Heft 1, S. 129-146

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Antiviral activity of influenza A virus defective interfering particles against SARS-CoV-2 replication in vitro through stimulation of innate immunity

Rand, Ulfert; Kupke, Sascha Young; Shkarlet, Hanna; Hein, Marc Dominique; Hirsch, Tatjana; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Cicin-Sain, Luka; Reichl, Udo; Bruder, Dunja

In: Cells - Basel: MDPI, 2012, Bd. 10 (2021), 7, insges. 14 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

SARS-CoV-2 production in a scalable high cell density bioreactor

Offersgaard, Anna; Duarte Hernandez, Carlos Rene; Pihl, Anne Finne; Costa, Rui; Venkatesan, Nandine Prabhakar; Lin, Xiangliang; Pham, Long Van; Feng, Shan; Fahnøe, Ulrik; Scheel, Troels Kasper Høyer; Ramirez, Santseharay; Reichl, Udo; Bukh, Jens; Genzel, Yvonne; Gottwein, Judith Margarete

In: Vaccines - Basel: MDPI, Bd. 9 (2021), 7

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell culture-based production and in vivo characterization of purely clonal defective interfering influenza virus particles

Hein, Marc D.; Arora, Prerna; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Winkler, Michael; Genzel, Yvonne; Pöhlmann, Stefan; Schughart, Klaus; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo

In: BMC biology - Berlin: Springer, Bd. 19 (2021)

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Associated viral gene transfer vectors by membrane-based steric exclusion chromatography

Marichal-Gallardo, Pavel; Börner, Kathleen; Pieler, Michael M.; Sonntag-Buck, Vera; Obr, Martin; Bejarano, David; Wolff, Michael W.; Kräusslich, Hans-Georg; Reichl, Udo; Grimm, Dirk

In: Human gene therapy - New York, NY: Liebert, 2021, insgesamt 16 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Site-specific N-glycosylation analysis of animal cell culture-derived Zika virus proteins

Pralow, Alexander; Nikolay, Alexander; Leon, Arnaud; Genzel, Yvonne; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature, Bd. 11 (2021), Artikel 5147

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Comprehensive N‐glycosylation analysis of the influenza A virus proteins HA and NA from adherent and suspension MDCK cells

Pralow, Alexander; Hoffmann, Marcus; Nguyen-Khuong, Terry; Pioch, Markus; Hennig, René; Genzel, Yvonne; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: The FEBS journal / Vereinigung der Europäischen Biochemischen Gesellschaften - Oxford [u.a.] : Wiley-Blackwell, Bd. 288 (2021), Heft 16, S. 4869-4891

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High cell density perfusion process for high yield of influenza A virus production using MDCK suspension cells

Wu, Yixiao; Bissinger, Thomas; Genzel, Yvonne; Liu, Xuping; Reichl, Udo; Tan, Wen-Song

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 105 (2021), 4, S. 1421-1434

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Multienzyme cascades for the in vitro synthesis of guanosine diphosphate Lfucose

Mahour, Reza; Marichal-Gallardo, Pavel A.; Rexer, Thomas; Reichl, Udo

In: ChemCatChem - Weinheim: WILEY-VCH Verlag, Bd. 13 (2021), insges. 11 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Forschungsarbeiten am Institut für Verfahrenstechnik der OttovonGuerickeUniversität Magdeburg

Reichl, Udo; Seidel-Morgenstern, Andreas; Sundmacher, Kai; Tsotsas, Evangelos; Wachem, Berend

In: Chemie - Ingenieur - Technik - Weinheim : Wiley-VCH Verl., Bd. 93 (2021), Heft 3, S. 345-352

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Critical Assessment of MetaProteome Investigation (CAMPI) - a multi-laboratory comparison of established workflows

Van Den Bossche, Tim; Kunath, Benoit J.; Schallert, Kay; Schäpe, Stephanie S.; Abraham, Paul C.; Armengaud, Jean; Arntzen, Magnus Ø.; Bassignani, Ariane; Benndorf, Dirk; Fuchs, Steohan; Giannone, Richard J.; Griffin, Timothy J.; Hagen, Live H.; Halder, Rashi; Henry, Céline; Hettich, Robert L.; Heyer, Robert; Jagtap, Pratik; Jehmlich, Nico; Jensen, Marlene; Juste, Ctherine; Kleiner, Manuel; Langella, Olivier; Lehmann, Theresa; Leith, Emma; May, Patrick; Mesuere, Bart; Miotello, Guylaine; Peters, Samantha L.; Pible, Olivier; Queiros, Pedro T.; Reichl, Udo; Renard, Bernhard Y.; Schiebenhoefer, Henning; Sczyrba, Alexander; Tanca, Alessandro; Trappe, Kathrin; Trezzi, jean-Pierre; Uzzau, Sergio; Verschaffelt, Pieter; Bergen, Martin von; Wilmes, Paul; Wolf, Maximilian; Martens, Lennart; Muth, Thilo

In: Nature Communications - [London] : Nature Publishing Group UK , 2010, Bd. 12 (2021), S. 1-15, Artikel 7305

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Semi-continuous propagation of influenza A virus and its defective interfering particles - analyzing the dynamic competition to select candidates for antiviral therapy

Pelz, Lars; Rüdiger, Daniel; Dogra, Tanya; Alnaji, Fadi G.; Genzel, Yvonne; Brooke, Christopher B.; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo

In: Journal of virology - Baltimore, Md.: Soc., Bd. 95 (2021), 24, insges. 18 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell-free multi-enzyme synthesis and purification of uridine diphosphate galactose

Mahour, Reza; Lee, Ju Weon; Grimpe, Pia; Boecker, Simon; Grote, Valerian; Klamt, Steffen; Seidel-Morgenstern, Andreas; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo

In: ChemBioChem - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 22 (2021), S. 1-11

Begutachteter Zeitschriftenartikel

MPA_Pathway_Tool - user-friendly, automatic assignment of microbial community data on metabolic pathways

Walke, Daniel; Schallert, Kay; Ramesh, Prasanna; Benndorf, Dirk; Lange, Emanuel; Reichl, Udo; Heyer, Robert

In: International journal of molecular sciences - Basel : Molecular Diversity Preservation International, Bd. 22 (2021), Heft 20, Artikel 10992, insges. 12 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Continuous purification of influenza A virus particles using pseudo-affinity membrane chromatography

Fortuna, Raquel A.; Taft, Florian; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 342 (2021), S. 139-148

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A high cell density perfusion process for Modified Vaccinia virus Ankara production - process integration with inline DNA digestion and cost analysis

Gränicher, Gwendal; Babakhani, Masoud; Göbel, Sven; Jordan, Ingo; Marichal-Gallardo, Pavel; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley . - 2021, insges. 15 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell-free glycoengineering of the recombinant SARS-CoV-2 spike glycoprotein

Ruhnau, Johannes; Grote, Valerian; Juarez-Osorio, Mariana; Bruder, Dunja; Mahour, Reza; Rapp, Erdmann; Rexer, Thomas F. T.; Reichl, Udo

In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, 2013, Bd. 9 (2021), insges. 10 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell culture-based production of defective interfering influenza A virus particles in perfusion mode using an alternating tangential flow filtration system

Hein, Marc D.; Chawla, Anshika; Cattaneo, Maurizio; Kupke, Sascha Y.; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 105 (2021), S. 72517264

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Multiscale model of defective interfering particle replication for influenza A virus infection in animal cell culture

Rüdiger, Daniel; Pelz, Lars; Hein, Marc D.; Kupke, Sascha Y.; Reichl, Udo

In: PLoS Computational Biology/ Public Library of Science - San Francisco, Calif.: Public Library of Science, Bd. 17 (2021), 9, insges. 28 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Combining functional metagenomics and glycoanalytics to identify enzymes that facilitate structural characterization of sulfated N-glycans

Chuzel, Léa; Fossa, Samantha L.; Boisvert, Madison L.; Cajic, Samanta; Heenig, René; Ganatra, Mehul B.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Taron, Christopher H.

In: Microbial cell factories - London: Biomed Central, Bd. 20 (2021), S. 1-17

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Integrated cycles for urban biomass as a strategy to promote a CO2-neutral society - a feasibility study

Meinusch, Nicole; Kramer, Susanne; Körner, Oliver; Wiese, Jürgen; Seick, Ingolf; Beblek, Anita; Berges, Regine; Illenberger, Bernhard; Illenberger, Marco; Uebbing, Jennifer; Wolf, Maximilian; Saake, Gunter; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Heyer, Robert

In: Sustainability - Basel : MDPI, Bd. 13 (2021), Heft 17, Artikel 9505, insges. 22 S.

Dissertation

Process intensification and integration for the production of vaccines and viral vectors

Gränicher, Gwendal; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XXX, 222 Seiten, 8,49 MB), Illustrationen, Diagramme

Dissertation

Scalable multi-enzyme platforms for the in vitro glycoengineering of therapeutic proteins & synthesis of human milk oligosaccharides

Mahour, Reza; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2022, 1 Online-Ressource (XV, 170 Blätter, 5,8 MB), Illustrationen

Dissertation

Process intensification for the production of MVA and influenza A virus in high density suspension cultures of AGE1.CR.pIX cells

Vázquez Ramírez, Daniel; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XIV, 136 Seiten, 7,58 MB), Illustrationen

Dissertation

Mathematical models of influenza A virus infection - elucidating the impact of host cell factors and defective interfering particles on virus growth

Laske, Tanja; Sundmacher, Kai; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (XVIII, 233 Seiten, 17,07 MB), Illustrationen, Diagramme

Dissertation

Application of functional metagenomics to the field of glycobiology

Chuzel, Léa; Reichl, Udo

In: Düren: Shaker Verlag, 2022, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2021, XI, 229 Seiten - (Forschungsberichte aus dem Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme; Band 55), ISBN: 3-8440-8437-1 [Literaturverzeichnis: Seite 186-210]

Dissertation

Metaproteomanalyse methanogener Mikrobiome aus Anreicherungskulturen im Labormaßstab

Kohrs, Fabian; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Universitätsbibliothek, 2021, 1 Online-Ressource (IX, 123, A-J Seiten, 3,84 MB), Illustrationen

Herausgeberschaft

Advances in glycobiotechnology

Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Cham: Springer, 2021, viii, 461 Seiten - (Advances in biochemical engineering/biotechnology; 175), ISBN: 978-3-030-69589-7

2020

Artikel in Zeitschrift

Synthesis of lipid-linked oligosaccharides by a compartmentalized multi-enzyme cascade for the in vitro N-glycosylation of peptides

Rexer, Thomas F. T.; Wenzel, Lisa; Hoffmann, Marcus; Tischlik, Sebastian; Bergmann, Christin; Grote, Valerian; Boecker, Simon Matthias; Bettenbrock, Katja; Schildbach, Anna; Kottler, Robert; Mahour, Reza; Rapp, Erdmann; Pietzsch, Markus; Reichl, Udo

In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 322 (2020), S. 54-65

Aufsatz

Impact of feeding and stirring regimes on the internal stratification of microbial communities in the fermenter of anaerobic digestion plants

Heyer, Robert; Klang, Johanna; Hellwig, Patrick; Schallert, Kay; Kress, Philipp; Hülsemann, Benedikt; Theuerl, Susanne; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Bioresource technology - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science - 314(2020), Artikel-Nummer 123679, 1 Online-Ressource

Buchbeitrag

Perfusion control for high cell density cultivation and viral vaccine production

Nikolay, Alexander; Bissinger, Thomas; Gränicher, Gwendal; Wu, Yixiao; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Animal Cell Biotechnology: Methods and Protocols - New York, NY: Springer US; Pörtner, Ralf . - 2020, S. 141-168

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A dynamic model linking cell growth to intracellular metabolism and extracellular byproduct accumulation

Ramos, João R.; Rath, Alexander G.; Genzel, Yvonne; Sandig, Volker; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley . - 2020, insges. 21 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Production of Modified Vaccinia Ankara virus by intensified cell cultures - a comparison of platform technologies for viral vector production

Gränicher, Gwendal; Tapia, Felipe; Behrendt, Ilona; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Biotechnology journal - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 16 (2021), 1, insges. 10 S., 2020

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Application of an nnclined settler for cell culture-based influenza A virus production in perfusion mode

Coronel, Juliana; Gränicher, Gwendal; Sandig, Volker; Noll, Thomas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, Volume 8 (2020), article 672, insgesmat 13 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Virus harvesting in perfusion culture - choosing the right type of hollow fiber membrane

Nikolay, Alexander; Grooth, Joris; Genzel, Yvonne; Wood, Jeffery A.; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, 2020, insgesamt 13 Seiten[Online first]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Performance of an acoustic settler versus a hollow fiberbased ATF technology for influenza virus production in perfusion

Gränicher, Gwendal; Coronel, Juliana; Trampler, Felix; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 104.2020, S. 4877-4888

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Single-cell analysis uncovers a vast diversity in intracellular viral defective interfering RNA content affecting the large cell-to-cell heterogeneity in influenza A virus replication

Kupke, Sascha Young; Ly, Lam-Ha; Börno, Stefan Thomas; Ruff, Alexander; Timmermann, Bernd; Vingron, Martin; Haas, Stefan; Reichl, Udo

In: Viruses - Basel: MDPI, 12 (2020,1), Artikelnummer 71, 19 Seiten

Dissertation

Evaluation of MDCK suspension cell lines for influenza A virus production - media, metabolism, and process conditions

Bissinger, Thomas; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2020, XXVI, 137 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

Dissertation

Intensified yellow fever and Zika virus production in animal cell culture

Nikolay, Alexander; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2020, XV, 175 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm[Literaturverzeichnis: Seite 139-157]

Dissertation

In-depth mass spectrometry-based glycoproteomics - advances in sample preparation, measurement and data-analysis of glycoproteins

Hoffmann, Marcus; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Magdeburg, 2020, XI, 141 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm[Literaturverzeichnis: Seite 118-133]

Dissertation

Single-cell analysis of influenza A virus replication - sources of cell-to-cell heterogeneity and discoverey of a novel type of defective interfering particle

Kupke, Sascha Young; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2020, XV, 155 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm[Literaturverzeichnis: Seite 122-136]

2019

Abstract

Dialyseinduzierte Veränderungen im menschlichen Serum-Protein N-Glykosylation

Lindquist, Jonathan; Hennig, René; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Mertens, Peter Rene

In: Kongress für Nephrologie, 11. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Nephrologie: Die Nephrologie als ganzheitliche Disziplin in der Patientenversorgung : 10. 13. Oktober 2019 in Düsseldorf : Programm/ Kongress für Nephrologie, 2019, P256, S. 165

Aufsatz

RedCom - a strategy for reduced metabolic modeling of complex microbial communities and its application for analyzing experimental datasets from anaerobic digestion

Koch, Sabine; Kohrs, Fabian; Lahmann, Patrick; Bissinger, Thomas; Wendschuh, Stefan; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo

In: PLoS Computational Biology / Public Library of Science - San Francisco, Calif. : Public Library of Science - Vol. 15 (2019), 2, Artikel e1006759, insgesamt 32 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A novel type of influenza a virus-derived defective interfering particle with nucleotide substitutions in its genome

Kupke, Sascha Young; Riedel, Dietmar; Frensing, Timo; Zmora, Pawel; Reichl, Udo

In: Journal of virology: publ. by the American Society for Microbiology - Baltimore, Md.: Soc., 1967, Bd. 93.2019, 4, Art.-Nr. e01786, insges. 24 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Continuous influenza virus production in a tubular bioreactor system provides stable titers and avoids the von Magnus effect

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Wohlfahrth, Daniel; Sandig, Volker; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, 2006, 14 (2019), 11, article e0224317, insgesamt 21 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Influenza A virus production in a single-use orbital shaken bioreactor with ATF or TFF perfusion systems

Coronel, Juliana; Behrendt, Ilona; Bürgin, Tim; Anderlei, Tibor; Sandig, Volker; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 37.2019, 47, S. 7011-7018

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Semi-perfusion cultures of suspension MDCK cells enable high cell concentrations and efficient influenza A virus productionPK2.1

Bissinger, Thomas; Fritsch, Johannes; Mihut, Adrian; Wu, Yxiao; Liu, Xuping; Genzel, Yvonne; Tan, Wen-Song; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 37 (2019), 47, S. 7003-7010

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Efficient influenza A virus production in high cell density using the novel porcine suspension cell line PBG.PK2.1

Gränicher, Gwendal; Coronel, Juliana; Pralow, Alexander; Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Wolff, Michael; Rapp, Erdmann; Karlas, Alexander; Sandig, Volker; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 37.2019, 47, S. 7019-7028

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Production of Defective Interfering Particles of influenza A virus in parallel continuous cultures at two residence times - insights from qPCR measurements and viral dynamics modeling

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Laske, Tanja; Wasik, Milena A.; Rammhold, Markus; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology - Lausanne: Frontiers Media, 2013, Volume 7 (2019), Artikel 275, insgesamt 15 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Enzymatic cascades for tailored 13 C 6 and 15 N enriched human milk oligosaccharides

Fischöder, Thomas; Cajic, Samanta; Grote, Valerian; Greifenstein, Raphael; Reichl, Udo; Franzreb, Matthias; Rapp, Erdmann; Elling, Lothar

In: Molecules: a journal of synthetic chemistry and natural product chemistry - Basel: MDPI, 1996, Volume 24 (2019), 19, Artikel 3482, insgesamt 21 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A robust and universal metaproteomics workflow for research studies and routine diagnostics within 24 h using phenol extraction, FASP digest, and the MetaProteomeAnalyzer

Heyer, Robert; Schallert, Kay; Büdel, Anja; Zoun, Roman; Dorl, Sebastian; Behne, Alexander; Kohrs, Fabian; Püttker, Sebastian; Siewert, Corina; Muth, Thilo; Saake, Gunter; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Frontiers in microbiology - Lausanne: Frontiers Media, 10 (2019), article 1883, insgesamt 20 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Use of sulfated cellulose membrane adsorbers for chromatographic purification of cell cultured-derived influenza A and B viruses

Fortuna, A. Raquel; van Teeffelen, Sebastian; Ley, Adrian; Fischer, Laura M.; Taft, Florian; Genzel, Yvonne; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Separation and purification technology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1997, Bd. 226.2019, S. 350-358

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Metaproteomics of fecal samples of Crohn's disease and Ulcerative Colitis

Lehmann, Tony; Schallert, Kay; Vilchez-Vargas, Ramiro; Benndorf, Dirk; Püttker, Sebastian; Sydor, Svenja; Schulz, Christian; Bechmann, Lars Peter; Canbay, Ali E.; Heidrich, Benjamin; Reichl, Udo; Link, Alexander; Heyer, Robert

In: Journal of proteomics - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 201 (2019), S. 93-103

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Metaproteome analysis reveals that syntrophy, competition, and phage-host interaction shape microbial communities in biogas plants

Heyer, Robert; Schallert, Kay; Siewert, C.; Kohrs, F.; Greve, J.; Maus, I.; Klang, J.; Klocke, M.; Heiermann, M.; Hoffmann, Michael; Püttker, Sebastian; Calusinska, M.; Zoun, Roman; Saake, Gunter; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo

In: Microbiome - London : Biomed Central, Bd. 7 (2019), Artikel 69, insges. 17 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Hydrophobic-interaction chromatography for purification of influenza A and B virus

Weigel, Thomas; Soliman, Remon; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Journal of chromatography / B - New York, NY [u.a.]: Science Direct, Bd. 1117.2019, S. 103-117

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High titer MVA and influenza A virus production using a hybrid fed-batch/perfusion strategy with an ATF system

Vázquez Ramírez, Daniel; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 103 (2019), 7, S. 3025-3035

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A system for production of defective interfering particles in the absence of infectious influenza A virus

Bdeir, Najat; Arora, Prerna; Gärtner, Sabine; Hoffmann, Markus; Reichl, Udo; Pöhlmann, Stefan; Winkler, Michael

In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, Vol. 14.2019, 3, Artikel e0212757, insgesamt 18 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Enzymatic cascade synthesis provides novel linear human milk oligosaccharides as reference standards for xCGELIF based highthroughput analysis

Fischöder, Thomas; Cajic, Samanta; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Elling, Lothar

In: Biotechnology journal - Weinheim: Wiley-VCH, Vol. 14 (2019), 3, Artikelnr. 1800305, insges. 9 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High-throughput serum N-glycomics - method comparison and application to study rheumatoid arthritis and pregnancy-associated changes

Reiding, Karli R.; Bondt, Albert; Hennig, René; Gardner, Richard A.; O'Flaherty, Roisin; Trbojevič-Akmačič, Irena; Shubhakar, Archana; Hazes, Johanna M. W.; Reichl, Udo; Fernandes, Daryl L.; Pučič-Bakovič, Maja; Rapp, Erdmann; Spencer, Daniel I. R.; Dolhain, Radboud J. E. M.; Rudd, Pauline M.; Lauc, Gordon; Wuhrer, Manfred

In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 18.2019, 1, S. 3-15

Dissertation

Charakterisierung der Influenzavirus-Vermehrung in genetisch veränderten humanen Zelllinien zur Optimierung der Impfstoffproduktion

Bachmann, Mandy; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2019, XI, 173 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm[Literaturverzeichnis: Seite 133-155]

Dissertation

Herstellungsprozess für onkolytische Masernviren

Grein, Tanja A.; Reichl, Udo

In: Düren: Shaker Verlag, 2019, XII, 195 Seiten, 24 Illustrationen, Diagramme, 21 cm, 314 g - (Schriftenreihe des Institutes für Bioverfahrenstechnik und Pharmazeutische Technologie; Band 15)

Dissertation

Chromatographic purification of biological macromolecules by their capture on hydrophilic surfaces with the aid of non-ionic polymers

Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2019, xiii, 118 Blätter, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

Dissertation

Continuous upstream processing for cell culture-derived virus production

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2019, xv, 112 Blätter, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

2018

Begutachteter Zeitschriftenartikel

MPA portable - a stand-alone software package for analyzing metaproteome samples on the go

Muth, Thilo; Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Martens, Lennart; Renard, Bernhard Y.

In: Analytical chemistry - Columbus, Ohio : American Chemical Society , 1947, Bd. 90 (2018), Heft 1, S. 685-689

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Improvement of electrospray stability in negative ion mode for nano-PGC-LC-MS glycoanalysis via post-column make-up flow

Nguyen-Khuong, Terry; Pralow, Alexander; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Glycoconjugate journal: official journal of the International Glycoconjugate Organization - Dordrecht [u.a.]: Springer Science + Business Media B.V, Bd. 35.2018, 6, S. 499-509

Begutachteter Zeitschriftenartikel

The fine art of destruction - a guide to indepth glycoproteomic analyses-exploiting the diagnostic potential of fragment ions

Hoffmann, Marcus; Pioch, Markus; Pralow, Alexander; Henning, René; Kottler, Robert; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Proteomics - Weinheim: Wiley VCH, 2001, Vol. 18.2018, 24, Art.-Nr. 1800282

Begutachteter Zeitschriftenartikel

glyXtoolMS - an open-source pipeline for semiautomated analysis of glycopeptide mass spectrometry data

Pioch, Markus; Hoffmann, Marcus; Prahlow, Alexander; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Analytical chemistry: the authoritative voice of the analytical community - Columbus, Ohio: American Chemical Society, 1947, Bd. 90.2018, 20, S. 11908-11916

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A multiscale model of influenza A virus replication covering highly different infection conditions in cell cultures

Rüdiger, D.; Kupke, S. Y.; Reichl, Udo

In: IFAC-PapersOnLine/ Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt: Elsevier, Bd. 51.2018, 19, S. 32-33[Konferenz: 7th Conference on Foundation of Systems Biology in Engineering, FOSBE 2018, Chicago, Illinois, USA, 05-08 August 2018]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Mathematical modeling as a tool to improve influenza vaccine production processes

Duvigneau, Stefanie; Dürr, Robert; Laske, Tanja; Bachmann, Mandy; Dostert, Melanie; Reichl, Udo; Kienle, Achim

In: IFAC-PapersOnLine / Internationale Förderung für Automatische Lenkung - Frankfurt : Elsevier , 2015, Bd. 51 (2018), Heft 19, S. 1-4

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Process intensification of EB66® cell cultivations leads to high-yield yellow fever and Zika virus production

Nikolay, Alexander; Léon, Arnaud; Schwamborn, Klaus; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 102.2018, 20, S. 8725-8737

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Valorisation of deinking sludge as a substrate for lignocellulolytic enzymes production by Pleurotus ostreatus

Vodovnik, Maša; Vrabec, Katja; Hellwig, Patrick; Benndorf, Dirk; Sežun, Mija; Gregori, Andrej; Gottumukkala, Lalitha D.; Anderson, Robin C.; Reichl, Udo

In: Journal of cleaner production - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Vol. 197.2018, Part 1, S. 253-263

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Cell culture-based production of defective interfering particles for influenza antiviral therapy

Wasik, Milena A.; Eichwald, Luca; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 102.2018, 3, S. 1167-1177, 2017

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High-cell-density cultivations to increase MVA virus production

Vázquez Ramírez, Daniel; Genzel, Yvonne; Jordan, Ingo; Sandig, Volker; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 36 (2018), 22, S. 3124-3133

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Optimization of cell culture-derived influenza A virus particles purification using sulfated cellulose membrane adsorbers

Fortuna, Ana Raquel; Taft, Florian; Villain, Louis; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Engineering in life sciences - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 18.2018, 1, S. 29-39

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Purification of cell culture-derived influenza A virus via continuous anion exchange chromatography on monoliths

Fischer, Laura M.; Wolff, Michael; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 36.2018, 22, S. 3153-3160

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Propagation of Brazilian Zika virus strains in static and suspension cultures using Vero and BHK cells

Nikolay, Alexander; Castilho, Leda R.; Reichl, Udo; Genzel, Yvonne

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 36.2018, 22, S. 3140-3145

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Purification of influenza viruslike particles using sulfated cellulose membrane adsorbers

Carvalho, Sofia B.; Fortuna, A. Raquel; Wolff, Michael W.; Peixoto, Cristina; Alves, Paula M.; Reichl, Udo

In: Journal of chemical technology & biotechnology - Chichester: Wiley, Bd. 93.2018, 7, S. 1988-1996[Special issue: Bioseparations]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Establishment of a five-enzyme cell-free cascade for the synthesis of uridine diphosphate N-acetylglucosamine

Mahour, Reza; Klapproth, Jan; Rexer, Thomas F. T.; Schildbach, Anna; Klamt, Steffen; Pietzsch, Markus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 283.2018, S. 120-129

Begutachteter Zeitschriftenartikel

SDSPAGE fractionation to increase metaproteomic insight into the taxonomic and functional composition of microbial communities for biogas plant samples

Wenzel, Lisa; Heyer, Robert; Schallert, Kay; Löser, Lucy; Wünschiers, Röbbe; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 18 (2018), Heft 7, S. 498-509

2017

Buchbeitrag

Animal cell expression systems

Butler, M.; Reichl, Udo

In: Advances in biochemical engineering, biotechnology - Berlin: Springer, S. 1-36, 2017[Online first]

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Steric exclusion chromatography for purification of cell culture-derived influenza A virus using regenerated cellulose membranes and polyethylene glycol

Marichal-Gallardo, Pável Alejandro; Pieler, Michael M.; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Journal of chromatography - New York, NY [u.a.] : Science Direct, Bd. 1483.2017, S. 110-119

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Proteotyping of laboratory-scale biogas plants reveals multiple steady-states in community composition

Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Bissinger, Thomas; Kottler, Robert; Schallert, Kay; Püttker, Sebastian; Behne, Alexander; Rapp, Erdmann; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo

In: Anaerobe - London : Academic Press , 1995, Bd. 46 (2017), S. 56-68

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Specific ion effects on the particle size distributions of cell culturederived influenza A virus particles within the Hofmeister series

Pieler, Michael Martin; Heyse, Anja; Wolff, Michael Werner; Reichl, Udo

In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 17.2017, 5, S. 470-478

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Improvement of the glycoproteomic toolbox with the discovery of a unique C-terminal cleavage specificity of flavastacin for N-glycosylated asparagine

Pralow, Alexander; Hoffmann, Marcus; Nguyen-Khuong, Terry; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Scientific reports - [London] : Macmillan Publishers Limited, part of Springer Nature - Bd. 7.2017, Art.-Nr. 11419, insgesamt 9 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Influence of the production system on the surface properties of influenza A virus particles

Hämmerlein, Frank; Pieler, Michael M.; Hennig, René; Serve, Anja; Rapp, Erdmann; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Hubbuch, Jürgen

In: Engineering in life sciences - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 17.2017, 10, S. 1071-1077

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Efficient and stable production of Modified Vaccinia Ankara virus in two-stage semi-continuous and in continuous stirred tank cultivation systems

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Jordan, Ingo; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: PLOS ONE - San Francisco, California, US : PLOS - Bd. 12.2017, 8, Art.-Nr. e0182553, insges. 17 Seiten

Begutachteter Zeitschriftenartikel

One pot synthesis of GDP-mannose by a multi-enzyme cascade for enzymatic assembly of lipid-linked oligosaccharides

Rexer, Thomas F. T.; Schildbach, Anna; Klapproth, Jan; Schierhorn, Angelika; Mahour, Reza; Pietzsch, Markus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.]: Wiley, Bd. 115 (2018), 1, S. 192-205

Dissertation

Charakterisierung von mikrobiellen Gemeinschaften aus Biogasanlagen mittels Metaproteomanalyse und Korrelationen der Ergebnisse zu den Prozessparametern

Heyer, Robert Steven; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Dissertation Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, Fakultät für Verfahrens- und Systemtechnik 2017, XVII, 164, xxxvii Blätter, Illustrationen

Dissertation

Characterisation of cell growth, metabolism and recombinant protein production during transient and steady state conditions for the human cell line AGE1.HN.AAT

Rath, Alexander; Sundmacher, Kai; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2017, XV, 178, xvi Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

Dissertation

Investigation of influenza virus particle aggregation and purification with magnetic sulfated cellulose particles

Pieler, Michael Martin; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2017, xxv, 97 Seiten, Illustrationen

2016

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Bioreactors for high cell density and continuous multi-stage cultivations: options for process intensification in cell culture-based viral vaccine production

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Vázquez Ramírez, Daniel; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 100 (2016), 5, S. 2121-2132

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Predicting compositions of microbial communities from stoichiometric models with applications for the biogas process

Koch, Sabine; Benndorf, Dirk; Fronk, Karen; Reichl, Udo; Klamt, Steffen

In: Biotechnology for biofuels - London: BioMed Central, Bd. 9 (2016), 17, insges. 16 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A membrane-based purification process for cell culture-derived influenza A virus

Weigel, Thomas; Solomaier, Thomas; Wehmeyer, Sebastian; Peuker, Alessa; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 220.2016, S. 12-20

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Binding kinetics and multi-bond : finding correlations by synthesizing interactions between ligand-coated bionanoparticles and receptor surfaces

Wang, Wenjing; Voigt, Andreas; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai

In: Analytical biochemistry : methods in the biological sciences. - San Diego, Calif : Elsevier, Bd. 505.2016, S. 8-17

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Metaproteomics applied to activated sludge for industrial wastewater treatment revealed a dominant methylotrophic metabolism of Hyphomicrobium zavarzinii

Salerno, Carlo; Benndorf, Dirk; Pech, Sabine; Palese, Luigi Leonardo; Reichl, Udo; Pollice, Alfieri

In: Microbial ecology - New York, NY: Springer . - 2016

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Influenza virus intracellular replication dynamics, release kinetics, and particle morphology during propagation in MDCK cells

Frensing, Timo; Kupke, Sascha Young; Bachmann, Mandy; Fritzsche, Susanne; Gallo-Ramirez, Lili E.; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 100.2016, 16, S. 7181-7192

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Towards personalized diagnostics via longitudinal study of the human plasma N-glycome

Hennig, René; Cajic, Samanta; Borowiak, Matthias; Hoffmann, Marcus; Kottler, Robert; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Biochimica et biophysica acta / General subjects: BBA - Amsterdam [u.a.]: Elsevier, 1964, Bd. 1860.2016, 8, S. 1728-1738

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Early changes in the metabolic profile of activated CD8+ T cells

Cammann, Clemens; Rath, Alexander; Reichl, Udo; Lingel, Holger; Brunner-Weinzierl, Monika; Simeoni, Luca; Schraven, Burkhart; Lindquist, Jonathan A.

In: BMC cell biology - London : BioMed Central - Bd. 17.2016, Art.-Nr. 28, insges. 11 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Reprint of "Modeling the intracellular replication of influenza A virus in the presence of defective interfering RNAs

Laske, Tanja; Heldt, Frank Stefan; Hoffmann, Helene; Frensing, Timo; Reichl, Udo

In: Virus research : an international journal of molecular and cellular virology. - Amsterdam [u.a.] : Elsevier Science, Bd. 218.2016, S. 86-95

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Diagnostic concept for dynamically operated biogas production plants

Bensmann, Astrid; Hanke-Rauschenbach, Richard; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Kausmann, Robert; Plöchl, Matthias; Heiermann, Monika; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai

In: Renewable energy - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Vol. 96.2016, Part A, S. 479-489

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Proteotyping of biogas plant microbiomes separates biogas plants according to process temperature and reactor type

Heyer, Robert; Benndorf, Dirk; Kohrs, F.; Vrieze, J.; Boon, N.; Hoffmann, M.; Rapp, Erdmann; Schlüter, A.; Sczyrba, A.; Reichl, Udo

In: Biotechnology for biofuels - London: BioMed Central, Bd. 9 (2016), 1

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Glycomic characterization of induced pluripotent stem cells derived from a patient suffering from phosphomannomutase 2 congenital Disorder of glycosylation (PMM2-CDG)

Thiesler, Christina T.; Cajic, Samanta; Hoffmann, Dirk; Thiel, Christian; Diepen, Laura van; Hennig, René; Sgodda, Malte; Weiβmann, Robert; Reichl, Udo; Steinemann, Doris; Diekmann, Ulf; Huber, Nicolas M. B.; Oberbeck, Astrid; Cantz, Tobias; Kuss, Andreas W.; Körner, Christian; Schambach, Axel; Rapp, Erdmann; Buettner, Falk F. R.

In: Molecular & cellular proteomics - Bethesda, Md. : The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 15 (2016), Heft 4, S. 1435-1452

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Impaired antiviral response of adenovirus-transformed cell lines supports virus replication

Bachmann, Mandy; Breitwieser, Theresa; Lipps, Christoph; Wirth, Dagmar; Jordan, Ingo; Reichl, Udo; Frensing, Timo

In: Journal of general virology: JGV - Reading: Soc., 1967, Bd. 97.2016, 2, S. 293-298

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Site-specific O-glycosylation analysis of human blood plasma proteins

Hoffmann, Marcus; Marx, Kristina; Reichl, Udo; Wuhrer, Manfred; Rapp, Erdmann

In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2002, Bd. 15.2016, 2, S. 624-641

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Sialic acid-specific affinity chromatography for the separation of erythropoietin glycoforms using serotonin as a ligand

Meininger, M.; Stepath, M.; Hennig, R.; Cajic, S.; Rapp, E.; Rotering, H.; Wolff, M. W.; Reichl, Udo

In: Journal of chromatography / B - New York, NY [u.a.]: Science Direct, 1977, Bd. 1012/1013.2016, S. 193-203

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A cell culture-derived whole virus influenza A vaccine based on magnetic sulfated cellulose particles confers protection in mice against lethal influenza A virus infection

Pieler, Michael M.; Frentzel, Sarah; Bruder, Dunja; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 34.2016, 50, S. 6367-6374

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Ezrin and HNRNP expression correlate with increased virus release rate and early onset of virus-induced apoptosis of MDCK suspension cells

Kluge, Sabine; Genzel, Yvonne; Laus, Kim; Serve, Anja; Pflugmacher, Antje; Peschel, Britta; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Biotechnology journal : BTJ ; systems & synthetic biology, nanobiotech, medicine. - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 11.2016, 10, S. 1332-1342

Dissertation

Modellbasierte Bestimmung von Interventionsstrategien zur Optimierung der Produktion von Biokraftstoffen in Cyanobakterien

Erdrich, Philipp; Reichl, Udo; Kienle, Achim

In: Magdeburg, 2016, xx, 158 Seiten, Illustrationen

Dissertation

Proteomanalytik der Adaption tierischer Zelllinien an Suspensionswachstum und optimierte Medien im Kontext der Impfstoffproduktion

Pech, Sabine; Reichl, Udo

In: Magdeburg: Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg, 2016, XXIV, 192, lxxvii Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

Dissertation

Novel computational methods for the analysis and interpretation of MS/MS data in metaproteomics

Muth, Thilo; Weiß, Helmut; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2016, XVI, 197 Seiten, Illustrationen

Dissertation

Purification of cell culture-derived influenza virus using simulated moving bed chromatography

Kröber, Tina; Reichl, Udo; Seidel-Morgenstern, Andreas

In: Magdeburg, 2016, XX, 171 Seiten, Illustrationen, Diagramme, 30 cm

Dissertation

Etablierung und Anwendung einer durchflusszytometrischen Methode für die Vitalitätsbestimmung von P. aeruginosa, B. cepacia und S. aureus in Mischkulturen

Rüger, Marc; Reichl, Udo

In: Magdeburg, 2016, XIV, 161, viii Blätter, Illustrationen

2015

Aufsatz

The MetaProteomeAnalyzer - a powerful open-source software suite for metaproteomics data analysis and interpretation

Muth, Thilo; Behne, Alexander; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Hoffmann, Marcus; Lehtevä, Miro; Reichl, Udo; Martens, Lennart; Rapp, Erdmann

In: Journal of proteome research - Washington, DC : ACS Publications, Bd. 14 (2015), Heft 3, S. 1557-1565

Aufsatz

Metaproteomics of activated sludge from a wastewater treatment plant - a pilot study

Püttker, Sebastian; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Heyer, Robert; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3596-3601

Aufsatz

Comparison of influenza virus particle purification using magnetic sulfated cellulose particles with an established centrifugation method for analytics

Serve, Anja; Pieler, Michael Martin; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Wolff, Michael Werner; Reichl, Udo

In: Analytical chemistry - Columbus, Ohio : American Chemical Society, Bd. 87 (2015), Heft 21, S. 10708-10711

Aufsatz

Metaproteomics of complex microbial communities in biogas plants

Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Reichl, Udo; Benndorf, Dirk

In: Microbial biotechnology - Oxford : Wiley-Blackwell, Bd. 8 (2015), Heft 5, S. 749-763

Aufsatz

Fractionation of biogas plant sludge material improves metaproteomic characterization to investigate metabolic activity of microbial communities

Kohrs, Fabian; Wolter, Sophie; Benndorf, Dirk; Heyer, Robert; Hoffmann, Marcus; Rapp, Erdmann; Bremges, Andreas; Sczyrba, Alexander; Schlüter, Andreas; Reichl, Udo

In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3585-3589

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Bioreactor concepts for cell culture-based viral vaccine production

Gallo-Ramírez, Lilí Esmeralda; Nikolay, Alexander; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Expert review of vaccines - Abingdon, Oxon: Taylor & Francis, 2002, Bd. 14.2015, 9, S. 1181-1195

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Editorial: Can modern vaccine technology pursue the success of traditional vaccine manufacturing?

Grabherr, Reingard; Reichl, Udo

In: Biotechnology journal: BTJ : systems & synthetic biology, nanobiotech, medicine - Weinheim: Wiley-VCH, Bd. 10.2015, 5, S. 657-658

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Community shifts in a well-operating agricultural biogas plant - how process variations are handled by the microbiome

Theuerl, Susanne; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Maus, Irena; Wibberg, Daniel; Schlüter, Andres; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo; Pühler, Alfred; Klocke, Michael

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 99 (2015), 18, S. 7791-7803

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Navigating through metaproteomics data - a logbook of database searching

Muth, Thilo; Kolmeder, Carolin A.; Salojärvi, Jarkko; Keskitalo, Salla; Varjosalo, Markku; Verdam, Froukje J.; Rensen, Sander S.; Reichl, Udo; Vos, Willem M.; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart

In: Proteomics - Weinheim: Wiley VCH, 2001, Bd. 15.2015, 20, S. 3439-3453

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Colonic metaproteomic signatures of active bacteria and the host in obesity

Kolmeder, Carolin A.; Ritari, Jarmo; Verdam, Froukje J.; Muth, Thilo; Keskitalo, Salla; Varjosalo, Markku; Fuentes, Susana; Greve, Jan Willem; Buurman, Wim A.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart; Palva, Airi; Salonen, Anne; Rensen, Sander S.; Vos, Willem M.

In: Proteomics - Weinheim : Wiley VCH, Bd. 15 (2015), Heft 20, S. 3544-3552

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Monitoring changes in proteome during stepwise adaptation of a MDCK cell line from adherence to growth in suspension

Pech, Sabine; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Scharfenberg, Klaus; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 33 (2015), 35, S. 4269-4280

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Exclusive decoration of simian immunodeficiency virus Env with high-mannose type N-glycans is not compatible with mucosal transmission in rhesus macaques

Karsten, Christina B.; Buettner, Falk F. R.; Cajic, Samanta; Nehlmeier, Inga; Neumann, Berit; Klippert, Antonina; Sauermann, Ulrike; Reichl, Udo; Gerardy-Schahn, Rita; Rapp, Erdmann; Stahl-Hennig, Christiane; Pöhlmann, Stefan

In: Journal of virology: publ. by the American Society for Microbiology - Baltimore, Md.: Soc., 1967, Bd. 89.2015, 22, S. 11727-11733

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Modeling the intracellular replication of influenza A virus in the presence of defective interfering RNAs

Laske, Tanja; Heldt, Frank Stefan; Hoffmann, Helene; Frensing, Timo; Reichl, Udo

In: Virus research: an international journal of molecular and cellular virology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, 1984, Bd. 213.2015, S. 90-99

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Single-cell analysis and stochastic modelling unveil large cell-to-cell variability in influenza A virus infection

Heldt, Frank S.; Kupke, Sascha Young; Dorl, Sebastian; Reichl, Udo; Frensing, Timo

In: Nature Communications - [London]: Nature Publishing Group UK, 2010, Vol. 6.2015, Art. 8938, insgesamt 12 S.

Dissertation

Population balance modeling of influenza A virus replication in MDCK cells during vaccine production

Müller, Thomas; Kienle, Achim; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Univ., Fak. für Elektrotechnik und Informationstechnik, Diss., 2015, X, 127 S., graph. Darst.

Dissertation

Infection dynamics and virus-induced apoptosis in influenza virus A infected adherent and suspension MDCK cells

Peschel, Britta; Reichl, Udo; Marwan, Wolfgang

In: Zugl.: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2015: Aachen: Shaker, VI, 180 S., Ill., graph. Darst., 21 cm, 291 g - (Forschungsberichte aus dem Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme; 44)

Dissertation

Mathematical models of influenza A virus infection - from intracellular replication to virus growth in cell populations

Heldt, Frank Stefan; Frensing, Timo; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2015, 2014, XX, 190 S., graph. Darst.

2014

Aufsatz

Sample prefractionation with liquid isoelectric focusing enables in depth microbial metaproteome analysis of mesophilic and thermophilic biogas plants

Kohrs, Fabian; Heyer, Robert; Magnussen, A.; Benndorf, Dirk; Muth, Thilo; Behne, Alexander; Rapp, Erdmann; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Klocke, Michael; Reichl, Udo

In: Anaerobe - London : Academic Press, Bd. 29 (2014), S. 59-67

Aufsatz

Impact of cultivation conditions on N-glycosylation of influenza virus A hemagglutinin produced in MDCK cell culture

Rödig, Jana; Rapp, Erdmann; Bohne, Jana; Kampe, Michael; Kaffka, Helene; Bock, Andreas; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley, Bd. 110 (2014), Heft 6, S. 1691-1703

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Changes in intracellular metabolite pools during growth of adherent MDCK cells in two different media

Rehberg, M.; Rath, A.; Ritter, J. B.; Genzel, Y.; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 98.2014, 1, S. 385-397

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Glycolysis is governed by growth regime and simple enzyme regulation in adherent MDCK cells

Rehberg, Markus; Ritter, Joachim B.; Reichl, Udo

In: PLoS Computational Biology: a new community journal - San Francisco, Calif: Public Library of Science, Vol. 10.2014, 10, Art. e1003885, insgesamt 16 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

High cell density cultivations by alternating tangential flow (ATF) perfusion for influenza A virus production using suspension cells

Genzel, Yvonne; Vogel, Thomas; Buck, Johannes; Behrendt, Ilona; Vázquez Ramírez, Daniel; Schiedner, Gudrun; Jordan, Ingo; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, Bd. 32 (2014), 24, S. 2770-2781

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Species-specific viability analysis of Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia and Staphylococcus aureus in mixed culture by flow cytometry

Rüger, Marc; Ackermann, Mandy; Reichl, Udo

In: BMC microbiology - London: BioMed Central, Bd. 14.2014, Art. 56, insgesamt 15 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

The influence of cell growth and enzyme activity changes on intracellular metabolite dynamics in AGE1.HN.AAT cells

Rath, Alexander; Rehberg, Markus; Janke, Robert; Genzel, Yvonne; Scholz, Sebastian; Noll, Thomas; Rose, Thomas; Sandig, Volker; Reichl, Udo

In: Journal of biotechnology - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 178.2014, S. 43-53

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Avidity of influenza virus: Model-based identification of adsorption kinetics from surface plasmon resonance experiments

Wang, Wenjing; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai

In: Journal of chromatography / A - New York, NY [u.a.]: Science Direct, Bd. 1326.2014, S. 125-129

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Production of high-titer human influenza A virus with adherent and suspension MDCK cells cultured in a single-use hollow fiber bioreactor

Tapia Delgado, Felipe Ignacio; Vogel, Thomas; Genzel, Yvonne; Behrendt, Ilona; Hirschel, Mark; Gangemi, J. David; Reichl, Udo

In: Vaccine - Amsterdam: Elsevier, 1983, Bd. 32.2014, 8, S. 1003-1011

Begutachteter Zeitschriftenartikel

The avian cell line AGE1.CR.pIX characterized by metabolic flux analysis

Lohr, Verena; Hädicke, Oliver; Genzel, Yvonne; Jordan, Ingo; Büntemeyer, Heino; Klamt, Steffen; Reichl, Udo

In: BMC biotechnology - London: BioMed Central, Vol. 14.2014, Art. 72 insgesamt 14 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

A flow-through chromatography process for influenza A and B virus purification

Weigel, Thomas; Solomaier, Thomas; Peuker, Alessa; Pathapati, Trinath; Wolff, Michael W.; Reichl, Udo

In: Journal of virological methods - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 207.2014, S. 45-53

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Biological methanation of hydrogen within biogas plants - a model-based feasibility study

Bensmann, Astrid; Hanke-Rauschenbach, R.; Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai

In: Applied energy - Amsterdam [u.a.]: Elsevier Science, Bd. 134 (2014), S. 413-425

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Flow cytometric viability assessment of lactic acid bacteria starter cultures produced by fluidized bed drying

Bensch, Gerald; Rüger, Marc; Wassermann, Magdalena; Weinholz, Susann; Reichl, Udo; Cordes, Christiana

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 98.2014, 11, S. 4897-4909

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Impact of defective interfering particles on virus replication and antiviral host response in cell culture-based influenza vaccine production

Frensing, Timo; Pflugmacher, Antje; Bachmann, Mandy; Peschel, Britta; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, 1975, Bd. 98.2014, 21, S. 8999-9008

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Vaccine production - upstream processing with adherent or suspension cell lines

Genzel, Yvonne; Rödig, Jana; Rapp, Erdmann; Reichl, Udo

In: Animal Cell Biotechnology , 3rd ed. 2014 - Totowa, NJ : Humana Press , 2014, S. 371-393 - (Methods in Molecular Biology, Methods and Protocols; 1104)

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Comparative performance of four methods for high-throughput glycosylation analysis of immunoglobulin G in genetic and epidemiological

Huffman, Jennifer E.; Pučić-Baković, Maja; Klarić, Lucija; Hennig, René; Selman, Maurice H. J.; Vučković, Frano; Novokmet, Mislav; Krištić, Jasminka; Borowiak, Matthias; Muth, Thilo; Polašek, Ozren; Razdorov, Genadij; Gornik, Olga; Plomp, Rosina; Theodoratou, Evropi; Wright, Alan F.; Rudan, Igor; Hayward, Caroline; Campbell, Harry; Deelder, André M.; Reichl, Udo; Aulchenko, Yurii S.; Rapp, Erdmann; Wuhrer, Manfred; Lauc, Gordan

In: Molecular & cellular proteomics: MCP - Bethesda, Md: The American Society for Biochemistry and Molecular Biology, Bd. 13.2014, S. 1598-1610

Dissertation

Impact of cultivation conditions on N-glycosylation of influenza A virus hemagglutinin, on quasispecies composition, and on immunogenicity of virus preparations

Rödig, Jana Verena; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2014, XVII, 159, S44 Bl., graph. Darst.

Dissertation

Characterization of the avian designer cells AGE1.CR and AGE1.CR.plX considering growth, metabolism and production of influenza virus and Modified Vaccinia Virus Ankara (MVA)

Lohr, Verena; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Diss., 2014, IX, 178 S., Ill., graph. Darst., 30 cm

Habilitation

Improving industrial antibody manufacturing processes using animal cell culture technology

Pohlscheidt, Michael; Reichl, Udo

In: Magdeburg, Univ., Fak. für Verfahrens- und Systemtechnik, Habil.-Schr., 2014, Getr. Zählung, Ill., graph. Darst., 30 cm

Herausgeberschaft

Large-Scale Networks in Engineering and Life Sciences

Benner, Peter; Findeisen, Rolf; Flockerzi, Dietrich; Reichl, Udo; Sundmacher, Kai

In: Cham: Birkhäuser, 2014, Online-Ressource (XIV, 388 p. 111 illus., 63 illus. in color, online resource) - (Modeling and Simulation in Science, Engineering and Technology; SpringerLink; Bücher; Springer eBook Collection; Mathematics and Statistics), ISBN: 978-3-319-08437-4

2013

Aufsatz

Metaproteome analysis of the microbial communities in agricultural biogas plants

Heyer, Robert; Kohrs, Fabian; Benndorf, Dirk; Rapp, Erdmann; Kausmann, Robert; Heiermann, Monika; Klocke, Michael; Reichl, Udo

In: New biotechnology - New York, NY [u.a.] : Elsevier, Bd. 30 (2013), Heft 6, S. 614-622

Aufsatz

Distributed modeling of human influenza a virus–host cell interactions during vaccine production

Müller, Thomas; Dürr, Robert; Isken, Britta; Schulze-Horsel, Josef; Reichl, Udo; Kienle, Achim

In: Biotechnology & bioengineering - New York, NY [u.a.] : Wiley, Bd. 110 (2013), Heft 8, S. 2252-2266

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Elements in the development of a production process for modified vaccinia virus ankara

Jordan, Ingo; Lohr, Verena; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo; Sandig, Volker

In: Microorganisms. - Basel : MDPI, Bd. 1.2013, 1, S. 100-121

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Multiscale modeling of influenza A virus infection supports the development of direct-acting antivirals

Heldt, Frank S.; Frensing, Timo; Pflugmacher, Antje; Gröpler, Robin; Peschel, Britta; Reichl, Udo

In: PLoS Computational Biology: a new community journal/ Public Library of Science - San Francisco, Calif.: Public Library of Science, 2005, Bd. 9.2013, 11, Art. e1003372, insges. 13 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Proteomics in environmental and technical microbiology

Benndorf, Dirk; Reichl, Udo

In: Engineering in life sciences - Weinheim: Wiley-VCH, 2001, Bd. 14.2013, 1, S. 27-46

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Evaluating differences of metabolic performances - statistical methods and their application to animal cell cultivations

Hädicke, O.; Lohr, V.; Genzel, Y.; Reichl, Udo; Klamt, S.

In: Biotechnology & bioengineering. - New York, NY [u.a.] : Wiley, Bd. 110.2013, 10, S. 2633-2642

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Comparison of influenza virus yields and apoptosis-induction in an adherent and a suspension MDCK cell line

Peschel, B.; Frentzel, S.; Laske, T.; Genzel, Y.; Reichl, Udo

In: Vaccine. - Amsterdam : Elsevier, Bd. 31.2013, 48, S. 5693-5699

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Batch-to-batch variability of two human designer cell lines - AGE1.HN and AGE1.HN.AAT ; carried out by different laboratories under defined culture conditions using a mathematical model

Freund, Susann; Rath, Alexander; Barradas, Oscar Platas; Skerhutt, Eva; Scholz, Sebastian; Niklas, Jens; Sandig, Volker; Rose, Thomas; Heinzle, Elmar; Noll, Thomas; Pörtner, Ralf; Zeng, An-Ping; Reichl, Udo

In: Engineering in life sciences - Weinheim: Wiley-VCH, 2001, Bd. 13.2013, 6, S. 580-592

Begutachteter Zeitschriftenartikel

PPARα and fatty acid oxidation mediate glucocorticoid resistance in chronic lymphocytic leukemia

Tung, Stephanie; Shi, Yonghong; Wong, Karry; Zhu, Fang; Gorczynski, Reg; Laister, Robert C.; Minden, Mark; Blechert, Anne-Kareen; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo; Spaner, David E.

In: Blood. - Stanford, Calif : HighWire Press, Bd. 112.2013, 6, S. 969-980

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Continuous influenza virus production in cell culture shows a periodic accumulation of defective interfering particles

Frensing, Timo; Stefan, Frank; Pflugmacher, Antje; Behrendt, Ilona; Jordan, Ingo; Flockerzi, Dietrich; Genzel, Yvonne; Reichl, Udo

In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, 2006, Vol. 8.2013, 9, Art. e72288, insgesamt 9 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Development of a high-throughput glycoanalysis method for the characterization of oligosaccharides in human milk utilizing multiplexed capillary gel electrophoresis with laser-induced fluorescence detection

Kottler, Robert; Mank, Marko; Hennig, René; Müller-Werner, Beate; Stahl, Bernd; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Electrophoresis. - Weinheim : Wiley-Blackwell, Bd. 34.2013, 16, S. 2323-2336

Begutachteter Zeitschriftenartikel

glyXalign - high-throughput migration time alignment preprocessing of electrophoretic data retrieved via multiplexed capillary gel electrophoresis with laser-induced fluorescence detection-based glycoprofiling

Behne, Alexander; Muth, Thilo; Borowiak, Matthias; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann

In: Electrophoresis. - Weinheim : Wiley-Blackwell, Bd. 34.2013, 16, S. 2311-2315

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Continuous purification of influenza virus using simulated moving bed chromatography

Kröber, T.; Wolff, M. W.; Hundt, B.; Seidel-Morgenstern, Andreas; Reichl, Udo

In: Journal of chromatography / A - New York, NY [u.a.]: Science Direct, Bd. 1307 (2013), S. 99-110

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Metagenome and metaproteome analyses of microbial communities in mesophilic biogas-producing anaerobic batch fermentations indicate concerted plant carbohydrate degradation

Hanreich, Angelika; Schimpf, Ulrike; Zakrzewski, Martha; Schlüter, Andreas; Benndorf, Dirk; Heyer, Robert; Rapp, Erdmann; Pühler, Alfred; Reichl, Udo; Klocke, Michael

In: Systematic and applied microbiology - München: Elsevier, Bd. 36 (2013), 5, S. 330-338

Begutachteter Zeitschriftenartikel

CAP, a new human suspension cell line for influenza virus production

Genzel, Yvonne; Behrendt, Ilona; Rödig, Jana; Rapp, Erdmann; Kueppers, Claudia; Kochanek, Stefan; Schiedner, Gudrun; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 97 (2013), 1, S. 111-122, 2012

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Identification of growth phases and influencing factors in cultivation of AGE1.HN cells using set-based methods

Borchers, Steffen; Freund, Susann; Rath, Alexander; Streif, Stefan; Reichl, Udo; Findeisen, Rolf

In: PLOS ONE - San Francisco, California, US: PLOS, 2006, Vol. 8.2013, 8, Art. e68124, insgesamt 11 S.

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Proteome analysis of virushost cell interaction - rabies virus replication in Vero cells in two different media

Pech, Sabine; Rourou, Samia; Vester, Diana; Majoul, Samy; Benndorf, Dirk; Genzel, Yvonne; Rapp, Erdmann; Kallel, Héla; Reichl, Udo

In: Applied microbiology and biotechnology - Berlin: Springer, Bd. 97 (2013), 12, S. 5493-5506

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Searching for a needle in a stack of needles: challenges in metaproteomics data analysis

Muth, Thilo; Benndorf, Dirk; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Martens, Lennart

In: Molecular BioSystems - Cambridge: Royal Society of Chemistry, Bd. 9 (2013), 4, S. 578-585

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Herstellung moderner Grippeimpfstoffe

Genzel, Yvonne; Frensing, Timo; Reichl, Udo

In: Chemie in unserer Zeit. - Weinheim : Wiley-VCH, Bd. 47.2013, 1, S. 12-22

Begutachteter Zeitschriftenartikel

Toward animal cell culturebased influenza vaccine design - viral hemagglutinin N-glycosylation markedly impacts immunogenicity

Hütter, Julia; Rödig, Jana; Höper, Dirk; Seeberger, Peter H.; Reichl, Udo; Rapp, Erdmann; Lepenies, Bernd

In: The journal of immunology - Bethesda, Md.: Soc., Bd. 190 (2013), 1, S. 220-230

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Vita

1980 - 1987

Studium Biologie, Diplom, Universität Saarbrücken

1991

Promotion am Institut für Systemdynamik der Universität Stuttgart, Abschluss: Doktoringenieur (Dr.-Ing.)

1991 - 1992

Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Biotechnologie, University of British Columbia, Vancouver, Kanada

1992 - 1993

Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Biotechnologie, Institut für Systemdynamik und Regelungstechnik, Universität Stuttgart

1993

Projektleiter „Mikrocarrier“, Pitman-Moore GmbH, Burgwedel

1993 - 1996

Abteilungsleiter Virusproduktion, Pitman-Moore GmbH, Burgwedel

1996 - 1999

Stellvertretender Herstellungsleiter, Mallinckrodt Vet GmbH / Essex Animal Health, Burgwedel

seit 1999

o. Professor für Bioprozesstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg

seit 2000

Wissenschaftliches Mitglied der Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V.

seit 2000

Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Abteilung System- und signalorientierte Bioprozesstechnik, Magdeburg

2003 - 2004

Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg

2005 - 2006

Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg

seit 2005

Mitglied der Perspektivenkommission der CPTS der Max-Planck-Gesellschaft

2007 - 2013

Sprecher der IMPRS ("International Max Planck Research School for Analysis, Design and Optimization in Chemical and Biochemical Process Engineering"), Magdeburg

2009 - 2010

Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg

2011 - 2012

Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg

2017 - 2018

Geschäftsführender Leiter des Instituts für Verfahrenstechnik, Otto-von-Guericke-Universität, Magdeburg

2019 - 2020

Geschäftsführender Direktor am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Magdeburg

Profil
  • Fermentationstechnik
  • Säugerzellen, Hefen, Bakterien
  • Aufarbeitungstechnik
  • Modellierung, Simulation und Optimierung von Bioprozessen
  • Prozessüberwachung und -regelung

Letzte Änderung: 28.06.2023 - Ansprechpartner: Webmaster